113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1053 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  86.07 
 
 		 1508 aa  2634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  38.88 
 
 		 1489 aa  849    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  86.34 
 
 		 1508 aa  2602    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  41.45 
 
 		 1651 aa  853    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 		 1508 aa  3013    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  73.24 
 
 		 1508 aa  2196    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.59 
 
 		 1615 aa  519  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  29.46 
 
 		 1635 aa  499  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  29.12 
 
 		 1618 aa  476  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2156  filamentous haemagglutinin domain-containing protein  24.05 
 
 		 1631 aa  269  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.435206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2044  adhesin/hemagglutinin  23.81 
 
 		 1615 aa  266  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.105561  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  40.69 
 
 		 2827 aa  157  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.21 
 
 		 2670 aa  157  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  37.09 
 
 		 2758 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.57 
 
 		 1723 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  37.1 
 
 		 3443 aa  155  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  37.1 
 
 		 5212 aa  154  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  39.44 
 
 		 3563 aa  153  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  40 
 
 		 594 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.74 
 
 		 1730 aa  150  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2437  hypothetical protein  23.07 
 
 		 889 aa  148  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16487  hitchhiker  0.0003202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.73 
 
 		 3040 aa  147  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  38.31 
 
 		 6274 aa  147  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.64 
 
 		 3967 aa  147  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  40 
 
 		 5981 aa  147  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.43 
 
 		 3862 aa  142  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.41 
 
 		 3790 aa  141  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  35.56 
 
 		 3929 aa  139  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.56 
 
 		 3796 aa  139  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  36.18 
 
 		 1270 aa  138  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  31.82 
 
 		 2536 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  34.09 
 
 		 1841 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  35.56 
 
 		 3165 aa  130  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  27.02 
 
 		 3350 aa  129  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  37.3 
 
 		 812 aa  129  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.1 
 
 		 658 aa  128  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  32.49 
 
 		 1998 aa  127  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  31.91 
 
 		 3004 aa  126  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.67 
 
 		 923 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.37 
 
 		 2421 aa  125  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.82 
 
 		 3079 aa  125  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  34.92 
 
 		 3501 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  33.78 
 
 		 3322 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.61 
 
 		 2345 aa  122  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.5 
 
 		 3602 aa  121  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  33.21 
 
 		 3552 aa  121  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.51 
 
 		 2600 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.97 
 
 		 428 aa  120  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.13 
 
 		 3128 aa  119  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  32.06 
 
 		 2530 aa  118  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.42 
 
 		 3020 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  35.02 
 
 		 3141 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  35.02 
 
 		 3141 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  32.06 
 
 		 2588 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.3 
 
 		 721 aa  116  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  32.97 
 
 		 2737 aa  115  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.92 
 
 		 2786 aa  115  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.27 
 
 		 3884 aa  115  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  32.5 
 
 		 3147 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.85 
 
 		 2847 aa  113  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  33.33 
 
 		 3301 aa  112  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  32.25 
 
 		 3159 aa  112  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.08 
 
 		 3028 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.96 
 
 		 3785 aa  110  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  34.54 
 
 		 2984 aa  108  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.08 
 
 		 2782 aa  108  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.13 
 
 		 2666 aa  108  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  31.73 
 
 		 3081 aa  107  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.49 
 
 		 2818 aa  106  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  32.85 
 
 		 2691 aa  105  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  30.47 
 
 		 2751 aa  105  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.78 
 
 		 3480 aa  103  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.78 
 
 		 3378 aa  103  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  30.28 
 
 		 1745 aa  102  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  27.24 
 
 		 2449 aa  102  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.22 
 
 		 3475 aa  102  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  28.52 
 
 		 4966 aa  101  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.47 
 
 		 2545 aa  100  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  29.59 
 
 		 3141 aa  99.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  29.51 
 
 		 3144 aa  99.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.84 
 
 		 730 aa  97.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  28.34 
 
 		 3526 aa  97.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  29.7 
 
 		 3131 aa  96.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  27.48 
 
 		 2350 aa  92.8  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  30.93 
 
 		 463 aa  92.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.93 
 
 		 463 aa  92.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  28.95 
 
 		 905 aa  91.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  28.95 
 
 		 905 aa  91.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  28.95 
 
 		 898 aa  91.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  28.9 
 
 		 901 aa  91.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  28.95 
 
 		 911 aa  91.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  31.44 
 
 		 846 aa  90.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  28.9 
 
 		 893 aa  90.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  28.9 
 
 		 914 aa  89.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  31.85 
 
 		 846 aa  89.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  29.75 
 
 		 463 aa  89  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  27.93 
 
 		 1719 aa  89  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  30.51 
 
 		 716 aa  88.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.47 
 
 		 847 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0006  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.45 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>