114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1000 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  98.33 
 
 		 417 aa  832    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  76.61 
 
 		 418 aa  688    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  77.8 
 
 		 418 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  76.61 
 
 		 418 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4386  arginine deiminase  81.62 
 
 		 418 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  76.61 
 
 		 418 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  84.73 
 
 		 418 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  76.37 
 
 		 425 aa  686    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  76.61 
 
 		 418 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  76.61 
 
 		 425 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  76.61 
 
 		 425 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  76.61 
 
 		 425 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  77.59 
 
 		 416 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1038  arginine deiminase  98.33 
 
 		 417 aa  832    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  84.73 
 
 		 418 aa  762    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  100 
 
 		 419 aa  865    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4223  arginine deiminase  97.14 
 
 		 417 aa  823    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  72.55 
 
 		 418 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  78.04 
 
 		 419 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  74.7 
 
 		 417 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  64.61 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  60.49 
 
 		 409 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1391  arginine deiminase  62.89 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00832109  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  59.23 
 
 		 413 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  60.98 
 
 		 408 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0146  Arginine deiminase  58.11 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.152156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  59.27 
 
 		 408 aa  494  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  60.1 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  59.27 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  56.72 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0432  arginine deiminase  54.83 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.277961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0746  arginine deiminase  55.26 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0880775 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  46.25 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  45.28 
 
 		 406 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5730  Arginine deiminase  45.99 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  45.76 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  45.52 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  45.28 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  45.52 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  46.25 
 
 		 406 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  45.28 
 
 		 406 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3978  Arginine deiminase  44.74 
 
 		 419 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  45.59 
 
 		 407 aa  336  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  42.23 
 
 		 406 aa  336  5e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  42.69 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  42.23 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  40.15 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  40.59 
 
 		 415 aa  292  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  37.86 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  38.39 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  40.62 
 
 		 409 aa  285  9e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  38.35 
 
 		 419 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  38.63 
 
 		 436 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  39.36 
 
 		 399 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  39.36 
 
 		 399 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  39.36 
 
 		 399 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  37.35 
 
 		 401 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  38.35 
 
 		 402 aa  272  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  37.62 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11020  arginine deiminase  37.62 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00481648  normal  0.252626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  39.08 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  35.97 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  35.97 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  35.97 
 
 		 410 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  36.28 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  35.77 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  35.49 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  35.49 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  38.44 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  34.76 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  33.96 
 
 		 414 aa  247  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  35.63 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  33.09 
 
 		 410 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000122198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  34.7 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  34.7 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  35.71 
 
 		 403 aa  235  9e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  32.44 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000467571  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0451  arginine deiminase  34.29 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  32.27 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  33.25 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000529267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  33.41 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  34.87 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0871  arginine deiminase  32.61 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0203728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  32.2 
 
 		 406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  32.45 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  35.18 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  32.7 
 
 		 406 aa  219  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01620  arginine deiminase  32.22 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000811385 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06540  arginine deiminase  31.98 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00222308  normal  0.406316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  31.73 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000474348  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  30.6 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  32.69 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  31.73 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02360  arginine deiminase  32.22 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0263165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  30.88 
 
 		 409 aa  189  9e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  30.02 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0192  Arginine deiminase  28.21 
 
 		 501 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07960  arginine deiminase  30.66 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000386602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5777  Arginine deiminase  27.12 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  28.88 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>