33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0978 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  94.3 
 
 		 158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  92.41 
 
 		 158 aa  307  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  88.39 
 
 		 156 aa  290  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  74.19 
 
 		 157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  72.26 
 
 		 174 aa  244  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  70.97 
 
 		 163 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  63.23 
 
 		 163 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  62.18 
 
 		 159 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  64.05 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  62.42 
 
 		 160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  59.48 
 
 		 157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  59.48 
 
 		 157 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  59.48 
 
 		 157 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  59.48 
 
 		 157 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  58.17 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  61.74 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  48.37 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  51.27 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  42.25 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  47.1 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  44.52 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  43.59 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  46.25 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  34.03 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3840  hypothetical protein  26.25 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223195  normal  0.195443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  30.09 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  31.5 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3037  hypothetical protein  29.92 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3124  RNA polymerase factor sigma-70  40.38 
 
 		 334 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.093145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4291  hypothetical protein  28.69 
 
 		 220 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  31.5 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>