More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0919 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  94.94 
 
 		 476 aa  901    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  94.44 
 
 		 468 aa  881    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  74.57 
 
 		 468 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  73.02 
 
 		 468 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 475 aa  969    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  94.66 
 
 		 468 aa  892    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  69.05 
 
 		 475 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  73.23 
 
 		 468 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  44.51 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 		 491 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  44.51 
 
 		 491 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  45.81 
 
 		 489 aa  360  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  44.09 
 
 		 466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  43.31 
 
 		 472 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  40.35 
 
 		 465 aa  310  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  43.15 
 
 		 493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  40.56 
 
 		 466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 462 aa  296  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 		 474 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 		 466 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  40.64 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 		 462 aa  289  9e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 460 aa  289  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  38.94 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 456 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  39.36 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 482 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 		 464 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 491 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  35.1 
 
 		 462 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  34.87 
 
 		 462 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  34.21 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 521 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 462 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  33.11 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.48 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  32.46 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  33.8 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.58 
 
 		 465 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 463 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.56 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  29.44 
 
 		 464 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  29.55 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  30.42 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 464 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  31.89 
 
 		 466 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  32.57 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29.14 
 
 		 470 aa  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 		 434 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.44 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 427 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 470 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  31.96 
 
 		 439 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 433 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 427 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  29.55 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  31.28 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.24 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>