More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0776 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  100 
 
 
251 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  96.41 
 
 
251 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  96.41 
 
 
251 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4454  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  94.02 
 
 
251 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  86.35 
 
 
253 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  85.66 
 
 
254 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  85.66 
 
 
252 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  83.27 
 
 
259 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  88.76 
 
 
251 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0951  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  85.43 
 
 
259 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  84.46 
 
 
252 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.89 
 
 
253 aa  311  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  57.09 
 
 
253 aa  286  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.28 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  55.38 
 
 
257 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  55.1 
 
 
257 aa  278  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.28 
 
 
247 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.03 
 
 
254 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.22 
 
 
254 aa  274  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.06 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  54.66 
 
 
249 aa  272  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.82 
 
 
251 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2453  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  54.88 
 
 
253 aa  267  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.03 
 
 
249 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1546  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  56.5 
 
 
251 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  52.85 
 
 
245 aa  265  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.04 
 
 
266 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  53.04 
 
 
252 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.61 
 
 
256 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  52.82 
 
 
248 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  55.24 
 
 
251 aa  261  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  51.61 
 
 
252 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51.82 
 
 
259 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.8 
 
 
252 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.4 
 
 
252 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49 
 
 
255 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.23 
 
 
251 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.81 
 
 
251 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49 
 
 
255 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.37 
 
 
256 aa  256  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.59 
 
 
255 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  52.99 
 
 
254 aa  255  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.59 
 
 
255 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2481  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.51 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.07 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  54.07 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.56 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2579  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.51 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.23 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3001  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.51 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.271778  hitchhiker  0.00000961274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.79 
 
 
383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2390  adenylyltransferase  57.83 
 
 
251 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.648878  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0851  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.66 
 
 
249 aa  252  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0897  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.66 
 
 
249 aa  252  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.81 
 
 
249 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00793  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.66 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00810  hypothetical protein  54.66 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2818  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.66 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0884  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.66 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.58 
 
 
255 aa  251  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0976  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  54.25 
 
 
249 aa  251  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.22 
 
 
261 aa  251  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  50 
 
 
274 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.2 
 
 
387 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.19 
 
 
250 aa  249  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.77 
 
 
255 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  55.02 
 
 
259 aa  249  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.39 
 
 
383 aa  249  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.98 
 
 
383 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.94 
 
 
256 aa  248  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  48.79 
 
 
250 aa  248  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49 
 
 
250 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.06 
 
 
260 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.58 
 
 
252 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  48.4 
 
 
252 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.8 
 
 
390 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.59 
 
 
250 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49 
 
 
390 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.59 
 
 
250 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  48.58 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.58 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.22 
 
 
272 aa  246  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  48.58 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  48.58 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  48.58 
 
 
252 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  49 
 
 
390 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0131  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.98 
 
 
253 aa  244  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000839209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.19 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.18 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0913  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.01 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.82 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0996  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.01 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0975  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.01 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0125  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.98 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0188818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  48.81 
 
 
396 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.58 
 
 
253 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378887 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0613  adenylyltransferase  51.43 
 
 
248 aa  242  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0946  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.61 
 
 
249 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48 
 
 
392 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0886  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.61 
 
 
249 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>