More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0756 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  95.96 
 
 		 570 aa  1056    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  71.84 
 
 		 595 aa  804    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  95.96 
 
 		 570 aa  1057    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  75.94 
 
 		 583 aa  865    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  75 
 
 		 579 aa  842    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  71.96 
 
 		 586 aa  787    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  90.33 
 
 		 573 aa  1024    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  65.42 
 
 		 596 aa  717    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  60.61 
 
 		 580 aa  698    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  100 
 
 		 570 aa  1133    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  53.04 
 
 		 590 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  50.89 
 
 		 582 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  51.16 
 
 		 590 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  50.98 
 
 		 592 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  48.93 
 
 		 575 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  48.74 
 
 		 585 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  46.23 
 
 		 605 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  50.35 
 
 		 581 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.49 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.32 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  46.49 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  45.39 
 
 		 576 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  47.29 
 
 		 576 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  41.74 
 
 		 563 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  40.57 
 
 		 574 aa  382  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  39.96 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  38.48 
 
 		 575 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  37.82 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5808  sulphate transporter  50.65 
 
 		 497 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125757  normal  0.376579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  37.86 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  37.68 
 
 		 568 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  40.69 
 
 		 573 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  37.68 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  34.35 
 
 		 565 aa  339  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  35.51 
 
 		 588 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  38.66 
 
 		 571 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  35.79 
 
 		 566 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  34.18 
 
 		 585 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  38.8 
 
 		 587 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  34.24 
 
 		 585 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  34.06 
 
 		 585 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  35.81 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  34.12 
 
 		 590 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  32.09 
 
 		 569 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  32.09 
 
 		 569 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  33.88 
 
 		 585 aa  297  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  34.16 
 
 		 591 aa  296  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  34.57 
 
 		 584 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  33.39 
 
 		 579 aa  291  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  33.39 
 
 		 579 aa  291  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  34.38 
 
 		 569 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  34.29 
 
 		 585 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  34.29 
 
 		 585 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  34.29 
 
 		 585 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  34.29 
 
 		 585 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  35.64 
 
 		 556 aa  287  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  37.32 
 
 		 569 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  34.87 
 
 		 576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.4 
 
 		 572 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  33.84 
 
 		 592 aa  279  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  35.9 
 
 		 559 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  30.41 
 
 		 574 aa  277  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  37.15 
 
 		 591 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.86 
 
 		 585 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  34.47 
 
 		 600 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  31.46 
 
 		 574 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  33.83 
 
 		 567 aa  267  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.99 
 
 		 588 aa  266  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  33.01 
 
 		 592 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  32.89 
 
 		 578 aa  261  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  33.65 
 
 		 590 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  33.27 
 
 		 605 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  29.82 
 
 		 571 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  33.69 
 
 		 586 aa  249  8e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  34.72 
 
 		 583 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  31.24 
 
 		 583 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  31.14 
 
 		 575 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  30.69 
 
 		 592 aa  239  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30.81 
 
 		 585 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  29.32 
 
 		 570 aa  231  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  29.42 
 
 		 597 aa  231  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  29.32 
 
 		 570 aa  231  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  29.48 
 
 		 567 aa  231  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  32.37 
 
 		 572 aa  230  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  28.34 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  30.98 
 
 		 557 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.69 
 
 		 576 aa  225  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  32.59 
 
 		 550 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  26.65 
 
 		 588 aa  223  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  35.39 
 
 		 573 aa  223  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  32.2 
 
 		 558 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  27.97 
 
 		 578 aa  220  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  32.47 
 
 		 558 aa  216  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  29.58 
 
 		 573 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  29.85 
 
 		 570 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  29.66 
 
 		 570 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.062267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>