27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0711 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0711  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.19701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0679  hypothetical protein  99.38 
 
 		 171 aa  333  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.80583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0710  hypothetical protein  99.38 
 
 		 162 aa  332  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4506  hypothetical protein  98.77 
 
 		 162 aa  331  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4870  hypothetical protein  88.89 
 
 		 162 aa  303  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4586  hypothetical protein  83.95 
 
 		 185 aa  291  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4260  hypothetical protein  83.95 
 
 		 162 aa  289  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40870  hypothetical protein  70.99 
 
 		 168 aa  244  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.317722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5218  hypothetical protein  66.67 
 
 		 162 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60570  hypothetical protein  66.05 
 
 		 162 aa  214  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.672607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5247  hypothetical protein  64.63 
 
 		 168 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60960  hypothetical protein  64.63 
 
 		 168 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.775512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0758  hypothetical protein  62.96 
 
 		 168 aa  190  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2798  hypothetical protein  52.53 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.822855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2202  hypothetical protein  37.97 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.666334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3341  hypothetical protein  39.87 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1332  hypothetical protein  41.25 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2921  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000773857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0539  hypothetical protein  32.84 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000030974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0552  hypothetical protein  32.09 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000878259 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00184769  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2011  hypothetical protein  29.75 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2383  hypothetical protein  28.86 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000028196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0047  hypothetical protein  34.88 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0051  hypothetical protein  34.59 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0063  hypothetical protein  34.59 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0048  hypothetical protein  33.57 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>