More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0649 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 938 aa  840    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 938 aa  1117    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 938 aa  1118    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 987 aa  691    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 923 aa  874    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  97.99 
 
 		 943 aa  1936    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 916 aa  742    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 939 aa  1139    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2458  isoleucyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 		 960 aa  1122    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 921 aa  830    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 953 aa  1045    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0415  isoleucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 989 aa  818    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.686118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0485  isoleucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 930 aa  687    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 972 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 		 940 aa  1147    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  85.05 
 
 		 943 aa  1720    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 921 aa  825    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 921 aa  830    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 944 aa  1102    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 921 aa  830    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 945 aa  1124    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0963  isoleucyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 967 aa  828    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 931 aa  1032    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 931 aa  1031    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 959 aa  1106    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  84.84 
 
 		 943 aa  1717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 941 aa  1003    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 932 aa  1108    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1605  isoleucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 967 aa  659    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0410688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2745  isoleucyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 		 974 aa  1111    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 944 aa  1100    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  56.15 
 
 		 929 aa  1083    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 999 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 978 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 945 aa  1125    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0334  isoleucyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 973 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.765747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 940 aa  1120    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  86.64 
 
 		 943 aa  1737    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 984 aa  710    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 927 aa  897    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 945 aa  1113    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 973 aa  701    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 974 aa  709    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 923 aa  879    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 934 aa  833    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 943 aa  1044    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 921 aa  825    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 919 aa  698    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 960 aa  719    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 954 aa  748    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 943 aa  1081    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 971 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 940 aa  714    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 930 aa  839    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 945 aa  1136    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 946 aa  754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 1054 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 968 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 924 aa  857    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 992 aa  696    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 975 aa  1082    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 932 aa  1117    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 1024 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 934 aa  1019    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3849  isoleucyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 943 aa  1100    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471166  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 945 aa  1147    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 		 943 aa  1125    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 		 940 aa  1128    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 1001 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  70.4 
 
 		 946 aa  1399    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 999 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 947 aa  1014    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 959 aa  1101    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 938 aa  1004    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 936 aa  749    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 974 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 951 aa  1112    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 945 aa  1116    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 942 aa  1098    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0425  isoleucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 985 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 937 aa  1095    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 1152 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 940 aa  1157    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 		 940 aa  1160    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 941 aa  1112    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 943 aa  1137    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 927 aa  812    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 990 aa  671    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 945 aa  1114    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  82.93 
 
 		 943 aa  1650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 932 aa  705    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1139  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 921 aa  637    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.357484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 944 aa  703    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1487  isoleucyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 930 aa  644    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 929 aa  679    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 945 aa  1116    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 939 aa  1110    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 928 aa  855    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 954 aa  870    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 940 aa  1158    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>