211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0643 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  94.98 
 
 
219 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  92.69 
 
 
219 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  79.45 
 
 
219 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  78.54 
 
 
219 aa  324  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  65.45 
 
 
235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  66.05 
 
 
218 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  66.97 
 
 
219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  38.12 
 
 
229 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  37.63 
 
 
261 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  36.63 
 
 
221 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  36.59 
 
 
251 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  36.63 
 
 
221 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  36.63 
 
 
221 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  36.11 
 
 
221 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  38.46 
 
 
221 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  37.13 
 
 
220 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  36.63 
 
 
220 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  35.35 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  32.84 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  32.84 
 
 
207 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  35 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  36.55 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  32.16 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  31.84 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  33.17 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  34.2 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  36.53 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  38.55 
 
 
449 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  36.76 
 
 
221 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  32.66 
 
 
206 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  31.84 
 
 
207 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2129  paraquat-inducible protein A  33.66 
 
 
208 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00475203  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  35.38 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  32.32 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1900  Paraquat-inducible protein A  31.22 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00104452  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2444  paraquat-inducible protein A  31.22 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0158328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2564  paraquat-inducible protein A  31.22 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.794352  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2451  paraquat-inducible protein A  31.22 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2206  paraquat-inducible protein A  31.34 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  31.58 
 
 
227 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  31.84 
 
 
215 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  35.18 
 
 
213 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  32.67 
 
 
212 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1774  paraquat-inducible protein A  31.16 
 
 
211 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.233291  normal  0.160696 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  31.77 
 
 
423 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1798  paraquat-inducible protein A  30 
 
 
220 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0764034  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  38.55 
 
 
218 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1669  paraquat-inducible protein A  30.69 
 
 
211 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177227  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  28.87 
 
 
216 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1744  paraquat-inducible protein A  30.69 
 
 
211 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.457122  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  37.95 
 
 
218 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  37.95 
 
 
218 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  37.95 
 
 
218 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  37.95 
 
 
218 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  37.95 
 
 
218 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  37.95 
 
 
218 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1931  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 
209 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.29845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  32.12 
 
 
220 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  30.65 
 
 
224 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  37.5 
 
 
213 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  29.91 
 
 
252 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  29.44 
 
 
449 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 
198 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  32.67 
 
 
209 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  29.15 
 
 
208 aa  101  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  32.35 
 
 
215 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2232  paraquat-inducible protein A  30 
 
 
208 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2487  paraquat-inducible protein A  33.83 
 
 
208 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00109447  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  30.88 
 
 
216 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1581  paraquat-inducible protein A  31.5 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513887  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  35.86 
 
 
460 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  34.93 
 
 
462 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  29.52 
 
 
249 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  27.54 
 
 
402 aa  99  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  33 
 
 
210 aa  98.6  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  31.31 
 
 
220 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  34.39 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  28.02 
 
 
444 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  33.86 
 
 
259 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  27.32 
 
 
419 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  32.98 
 
 
292 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  29.38 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  27.18 
 
 
423 aa  94.7  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  28.31 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  29.21 
 
 
324 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  32.16 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  35.52 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  34.48 
 
 
406 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  32.16 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  27.85 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  26.44 
 
 
489 aa  92  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  25.64 
 
 
204 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  30.48 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  28.65 
 
 
416 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  30.48 
 
 
220 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  30.48 
 
 
220 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  30.48 
 
 
220 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  30.48 
 
 
220 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  27.72 
 
 
205 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>