264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0636 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  98.1 
 
 		 315 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  98.1 
 
 		 318 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  100 
 
 		 315 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  95.24 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  92.06 
 
 		 317 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  91.75 
 
 		 317 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  90.79 
 
 		 317 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  88.57 
 
 		 316 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  88.25 
 
 		 316 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  87.9 
 
 		 315 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  84.71 
 
 		 315 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  67.96 
 
 		 335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  60.32 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  61.66 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  61.27 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  62.42 
 
 		 375 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  60 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  63.02 
 
 		 349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  60.32 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  58.41 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  58.1 
 
 		 332 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  58.73 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  62.46 
 
 		 334 aa  394  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  58.79 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  59.49 
 
 		 346 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  58.54 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  57.56 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  58.86 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  60.65 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  60.84 
 
 		 350 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  58.99 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  59.62 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  58.47 
 
 		 345 aa  387  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  58.99 
 
 		 682 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  58.99 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  58.99 
 
 		 682 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  56.83 
 
 		 335 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  59.87 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  59.49 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  59.93 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  58.2 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  59.81 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  58.36 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  58.36 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  58.97 
 
 		 356 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  57.56 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  57.23 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  59.8 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  54.92 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  57.41 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  57.41 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  56.47 
 
 		 341 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  57.41 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  57.41 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  57.41 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  57.41 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  57.41 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  57.19 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  55.13 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  61.46 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  55.56 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  55.56 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  56.91 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  56.59 
 
 		 345 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  55.95 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  52.15 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  55.84 
 
 		 329 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  52.56 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  51.92 
 
 		 341 aa  339  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  52.48 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  51.28 
 
 		 347 aa  334  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  51.28 
 
 		 347 aa  334  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  50.97 
 
 		 338 aa  329  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  51.49 
 
 		 353 aa  324  9e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  54.84 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  49.84 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  46.98 
 
 		 341 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  46.47 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  49.2 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  43.81 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  47.62 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  45.22 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  41.88 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  41.48 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  43.04 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  43.91 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  42.95 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  44.1 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0307453 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  39.63 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.91 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  35.97 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl215  adenosine deaminase  33.44 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  29.66 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  37.96 
 
 		 336 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  33.75 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  36.93 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  31.73 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  30.94 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  30.92 
 
 		 366 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  31.09 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>