123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0618 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  84.11 
 
 		 574 aa  906    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  83.18 
 
 		 554 aa  896    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 554 aa  1105    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  63.13 
 
 		 552 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  47.96 
 
 		 558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.23 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.23 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  31.81 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  31.17 
 
 		 558 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  29.96 
 
 		 569 aa  243  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.76 
 
 		 569 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  30.71 
 
 		 557 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.74 
 
 		 561 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  30.14 
 
 		 561 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.14 
 
 		 561 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.94 
 
 		 561 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.54 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  29.74 
 
 		 561 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.54 
 
 		 561 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  27.97 
 
 		 551 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  27.97 
 
 		 551 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  27.97 
 
 		 551 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  27.97 
 
 		 559 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  27.97 
 
 		 551 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  27.97 
 
 		 551 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  27.97 
 
 		 559 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  28 
 
 		 597 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.55 
 
 		 572 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  26.37 
 
 		 565 aa  210  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  29.57 
 
 		 588 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.47 
 
 		 559 aa  130  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.79 
 
 		 553 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  29.03 
 
 		 568 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  27.32 
 
 		 568 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.24 
 
 		 560 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  26.85 
 
 		 599 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.05 
 
 		 592 aa  95.9  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.48 
 
 		 550 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  25.63 
 
 		 595 aa  90.9  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  26.07 
 
 		 607 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.91 
 
 		 584 aa  87.8  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  22.49 
 
 		 585 aa  87.4  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.4 
 
 		 747 aa  87.4  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  31.42 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.71 
 
 		 548 aa  84.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  26.28 
 
 		 553 aa  83.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.13 
 
 		 692 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.23 
 
 		 589 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.2 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  23.45 
 
 		 608 aa  80.9  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  22.69 
 
 		 588 aa  80.5  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.92 
 
 		 1391 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.38 
 
 		 583 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.48 
 
 		 586 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.06 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.83 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.75 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.33 
 
 		 1349 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.86 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  23.22 
 
 		 595 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.48 
 
 		 1570 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.95 
 
 		 580 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.5 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  22.5 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  22.5 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  22.5 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  26.17 
 
 		 624 aa  63.9  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.22 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.71 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  25.06 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  23.12 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.97 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.01 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  22.48 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.01 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  25.38 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.01 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.01 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.01 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.44 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.2 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.45 
 
 		 575 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  25 
 
 		 587 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.15 
 
 		 579 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  23.3 
 
 		 568 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  24.44 
 
 		 596 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  24.05 
 
 		 555 aa  54.7  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.66 
 
 		 561 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.12 
 
 		 574 aa  53.9  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 		 590 aa  53.5  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.21 
 
 		 576 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  23.5 
 
 		 568 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.44 
 
 		 571 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.61 
 
 		 585 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  26.47 
 
 		 570 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.95 
 
 		 576 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  25.57 
 
 		 576 aa  51.2  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.83 
 
 		 592 aa  50.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>