142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0615 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  52.48 
 
 		 1653 aa  1686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  52.48 
 
 		 1653 aa  1687    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  97 
 
 		 1633 aa  3173    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  38.3 
 
 		 1665 aa  1132    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  72.12 
 
 		 1649 aa  2395    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  72.71 
 
 		 1652 aa  2383    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  38.52 
 
 		 1727 aa  1046    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  52.66 
 
 		 1653 aa  1692    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  39.33 
 
 		 1635 aa  1023    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  37.5 
 
 		 1637 aa  1075    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  52.48 
 
 		 1653 aa  1686    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  52.45 
 
 		 1646 aa  1655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  52.45 
 
 		 1644 aa  1658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  52.76 
 
 		 1644 aa  1665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  52.63 
 
 		 1644 aa  1662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  52.48 
 
 		 1653 aa  1680    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.89 
 
 		 1650 aa  1672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  71.66 
 
 		 1664 aa  2317    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  97.18 
 
 		 1633 aa  3157    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.13 
 
 		 1619 aa  899    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.66 
 
 		 1653 aa  1692    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.48 
 
 		 1653 aa  1685    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  57.93 
 
 		 1663 aa  1845    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 		 1632 aa  3294    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.66 
 
 		 1653 aa  1692    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.75 
 
 		 1652 aa  1698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  91.92 
 
 		 1633 aa  3036    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1641 aa  963    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  36.17 
 
 		 1697 aa  906    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.12 
 
 		 1641 aa  962    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  31.92 
 
 		 1768 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.07 
 
 		 1832 aa  608  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  31.41 
 
 		 1805 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  31.82 
 
 		 1772 aa  594  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.53 
 
 		 1765 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  31.02 
 
 		 1758 aa  592  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.61 
 
 		 1772 aa  592  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  31.53 
 
 		 1759 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1839 aa  586  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.23 
 
 		 1835 aa  582  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.11 
 
 		 1824 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.33 
 
 		 1823 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.51 
 
 		 1768 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  29.63 
 
 		 1737 aa  569  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  29.6 
 
 		 1737 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.31 
 
 		 1737 aa  566  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  29.59 
 
 		 1739 aa  548  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  29.48 
 
 		 1737 aa  549  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1808 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  30.86 
 
 		 1815 aa  541  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1743 aa  539  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  30.06 
 
 		 1803 aa  536  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.78 
 
 		 1808 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.1 
 
 		 1782 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  29.57 
 
 		 1738 aa  532  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.54 
 
 		 1682 aa  528  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.04 
 
 		 1621 aa  524  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.69 
 
 		 1808 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1744 aa  489  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.76 
 
 		 1833 aa  483  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.53 
 
 		 1823 aa  456  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.35 
 
 		 1785 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1900  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.28 
 
 		 1828 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2253  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1569 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1807 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.18 
 
 		 1864 aa  332  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.73 
 
 		 1859 aa  327  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.48 
 
 		 1819 aa  322  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1028  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.73 
 
 		 1824 aa  321  6e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1529  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.82 
 
 		 1895 aa  302  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.753642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2191  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.59 
 
 		 1854 aa  295  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.64 
 
 		 1872 aa  289  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.58 
 
 		 1872 aa  288  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1898 aa  284  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.64 
 
 		 1872 aa  284  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.17 
 
 		 1992 aa  276  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.34 
 
 		 1992 aa  275  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  25.7 
 
 		 1925 aa  274  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1501  alpha-2-macroglobulin family N-terminal region domain protein  21.85 
 
 		 1761 aa  274  9e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.03 
 
 		 1998 aa  270  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1921 aa  259  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1921 aa  257  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1834 aa  248  4.9999999999999997e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.48 
 
 		 1821 aa  222  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  24.13 
 
 		 2002 aa  220  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1077  alpha-2-macroglobulin family protein  23.05 
 
 		 1717 aa  220  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0094392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1253  alpha-2-macroglobulin family protein  22.67 
 
 		 1707 aa  212  4e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.56 
 
 		 2000 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  23.19 
 
 		 2000 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.19 
 
 		 2000 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.09 
 
 		 1916 aa  201  9e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.95 
 
 		 1897 aa  195  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.47 
 
 		 1872 aa  177  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.21 
 
 		 1971 aa  153  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.28 
 
 		 1971 aa  147  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  23.8 
 
 		 1974 aa  147  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.06 
 
 		 2191 aa  146  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.86 
 
 		 2002 aa  145  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.72 
 
 		 2195 aa  140  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.06 
 
 		 2002 aa  136  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>