122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0584 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  556  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0539  hypothetical protein  95.94 
 
 		 271 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0578  hypothetical protein  96.31 
 
 		 271 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0591  hypothetical protein  89.67 
 
 		 271 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4995  hypothetical protein  81.65 
 
 		 270 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0723  hypothetical protein  75.37 
 
 		 269 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0625  hypothetical protein  76.58 
 
 		 269 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3828  hypothetical protein  74.53 
 
 		 275 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11700  hypothetical protein  73.98 
 
 		 276 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07950  hypothetical protein  69.14 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1075  hypothetical protein  73.23 
 
 		 276 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0695  hypothetical protein  47.83 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0769  hypothetical protein  47.62 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107825  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0865  hypothetical protein  44.66 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2829  hypothetical protein  48.31 
 
 		 261 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.816483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1873  hypothetical protein  43.19 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1159  hypothetical protein  41.7 
 
 		 247 aa  202  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2209  protein of unknown function DUF980  46.03 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.183224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1770  hypothetical protein  41.11 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.693928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1743  hypothetical protein  41.11 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1821  protein of unknown function DUF980  41.54 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.571233  normal  0.0506575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2366  putative inner membrane protein  41.8 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00016651  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0948  hypothetical protein  39.93 
 
 		 280 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1372  hypothetical protein  40.89 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2213  hypothetical protein  40.55 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.4309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2251  hypothetical protein  40.55 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2379  hypothetical protein  40.55 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1089  hypothetical protein  40.55 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260787 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0422  hypothetical protein  40.86 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5133  hypothetical protein  40.71 
 
 		 277 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635971  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2214  hypothetical protein  40.16 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.416427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1441  hypothetical protein  40.31 
 
 		 277 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.130559  hitchhiker  0.00999787 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6247  hypothetical protein  39.92 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1832  hypothetical protein  39.92 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1856  hypothetical protein  40.32 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1368  hypothetical protein  39.76 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1858  hypothetical protein  39.76 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0039  hypothetical protein  39.76 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1129  hypothetical protein  39.76 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1027  protein of unknown function DUF980  37.78 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.131102  normal  0.196659 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2033  hypothetical protein  39.52 
 
 		 259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.370372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1119  protein of unknown function DUF980  39.06 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2136  hypothetical protein  38.71 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0013  hypothetical protein  40.08 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3127  hypothetical protein  39.53 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.363658  normal  0.161606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1184  hypothetical protein  39.85 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0742773  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1395  hypothetical protein  40.48 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2458  protein of unknown function DUF980  39.75 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2119  hypothetical protein  37.69 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2711  hypothetical protein  40.54 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1665  hypothetical protein  40.64 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.754327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2392  hypothetical protein  39.68 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000626056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2490  hypothetical protein  39.68 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510585  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2066  hypothetical protein  41.74 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000683564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02840  hypothetical protein  45.15 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2166  hypothetical protein  41.32 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000309216  normal  0.207813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2219  hypothetical protein  41.32 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  0.573011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2162  hypothetical protein  41.32 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000383294  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2099  hypothetical protein  41.38 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.8651900000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3110  hypothetical protein  40.65 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2303  hypothetical protein  41.32 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000109705  hitchhiker  7.98783e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1670  hypothetical protein  41.38 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  normal  0.343591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01890  hypothetical protein  41.3 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01880  hypothetical protein  41.3 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000716342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1148  hypothetical protein  41.38 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113311  hitchhiker  0.0000000000000428732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2460  hypothetical protein  39.92 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.803917  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1479  hypothetical protein  39.84 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2259  hypothetical protein  40.95 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000106573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1676  protein of unknown function DUF980  40.87 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0614873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0993  Mlc titration factor MtfA  40.87 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000614673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0231  protein of unknown function DUF980  44.54 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2819  Mlc titration factor MtfA  40.87 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000714473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2557  protein of unknown function DUF980  38.66 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1587  protein of unknown function DUF980  39.42 
 
 		 265 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2377  hypothetical protein  36.8 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.993381  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2561  hypothetical protein  39.57 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00550602  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1105  hypothetical protein  34.9 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2672  hypothetical protein  35.02 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000377919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3008  hypothetical protein  35.91 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.127511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1355  protein of unknown function DUF980  35.91 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.841736  unclonable  0.00000000000208839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3023  hypothetical protein  35.91 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0902222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3166  hypothetical protein  35.91 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262871  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3335  hypothetical protein  35.04 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1211  hypothetical protein  34.88 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1281  hypothetical protein  34.88 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3456  hypothetical protein  34.94 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2335  protein of unknown function DUF980  34.4 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2870  hypothetical protein  36.29 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1210  hypothetical protein  34.5 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.749263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1249  hypothetical protein  33.2 
 
 		 274 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2917  hypothetical protein  36.15 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2687  hypothetical protein  32.94 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3095  protein of unknown function DUF980  35.88 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0055  hypothetical protein  36.78 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3868  protein of unknown function DUF980  34.94 
 
 		 274 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2172  hypothetical protein  34.9 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2898  hypothetical protein  35.59 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636756  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1279  hypothetical protein  31.37 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.42485  normal  0.255806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1418  hypothetical protein  31.33 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.955428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1531  hypothetical protein  31.23 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>