More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0510 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0514  catalase  96.45 
 
 		 479 aa  975    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  62.68 
 
 		 479 aa  634    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  97.29 
 
 		 479 aa  982    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  100 
 
 		 479 aa  1002    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  84.52 
 
 		 481 aa  860    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  87.66 
 
 		 484 aa  887    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  93.32 
 
 		 479 aa  943    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  64.92 
 
 		 485 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  64.06 
 
 		 481 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  62.92 
 
 		 483 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  63.96 
 
 		 487 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  65.19 
 
 		 487 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  63.6 
 
 		 478 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  63.73 
 
 		 499 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  62.82 
 
 		 482 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  62.39 
 
 		 482 aa  631  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  62.05 
 
 		 488 aa  631  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  60.96 
 
 		 481 aa  628  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  62.26 
 
 		 483 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  62.76 
 
 		 485 aa  624  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  61.76 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  64.14 
 
 		 485 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2776  catalase  61.76 
 
 		 479 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  62.63 
 
 		 487 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1320  catalase  61.76 
 
 		 479 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  62.21 
 
 		 480 aa  621  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  62.39 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2855  catalase  61.55 
 
 		 479 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2262  catalase-like  62.63 
 
 		 477 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  63.35 
 
 		 498 aa  619  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1958  catalase  62.39 
 
 		 483 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  62.89 
 
 		 485 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  61.55 
 
 		 480 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3278  catalase  60.42 
 
 		 478 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  61.73 
 
 		 484 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  61.32 
 
 		 493 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  61.73 
 
 		 484 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  60.8 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  61.81 
 
 		 493 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  62.03 
 
 		 485 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2489  catalase  62.29 
 
 		 484 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.350666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  61.32 
 
 		 491 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  60.33 
 
 		 478 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  59.12 
 
 		 480 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  61.39 
 
 		 490 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  60.91 
 
 		 491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  61.11 
 
 		 486 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  61.03 
 
 		 486 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  60.49 
 
 		 491 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  60.97 
 
 		 484 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  60.91 
 
 		 491 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0269  catalase  61.18 
 
 		 504 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146052  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  60.41 
 
 		 486 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  60.62 
 
 		 486 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  60.54 
 
 		 487 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  60.41 
 
 		 486 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  61.08 
 
 		 486 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  59.37 
 
 		 496 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  61.02 
 
 		 488 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  61.02 
 
 		 488 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1999  catalase  61.18 
 
 		 514 aa  592  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209766  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0656  catalase  60.76 
 
 		 506 aa  592  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1395  catalase  57.61 
 
 		 505 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000176487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  60.38 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1422  catalase  57.61 
 
 		 505 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000148509  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  60.5 
 
 		 480 aa  587  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  60.41 
 
 		 488 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0903  catalase  57.44 
 
 		 504 aa  584  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  60.17 
 
 		 517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  59.59 
 
 		 486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0322  catalase  58.95 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0355  catalase  58.74 
 
 		 499 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.692778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  58.53 
 
 		 501 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1147  catalase  60.38 
 
 		 479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11065  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3054  catalase  58.32 
 
 		 499 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  60.21 
 
 		 474 aa  570  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  56.37 
 
 		 490 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  58.56 
 
 		 474 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  56.58 
 
 		 491 aa  558  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  57.41 
 
 		 507 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  58.56 
 
 		 474 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0383  catalase  57.81 
 
 		 494 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  56.39 
 
 		 504 aa  555  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  58.56 
 
 		 474 aa  558  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  55.95 
 
 		 490 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  56.25 
 
 		 505 aa  554  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  55.74 
 
 		 490 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5463  Catalase  53.77 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  55.84 
 
 		 555 aa  525  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0342  Catalase  60.86 
 
 		 556 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  56.3 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0481  catalase  55.41 
 
 		 498 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  54.45 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0546  Catalase  53.47 
 
 		 574 aa  514  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0803  catalase  53.73 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3238  Catalase  54.03 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.067006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0236  catalase  53.04 
 
 		 482 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  52.48 
 
 		 483 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  53.31 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3730  catalase  52.43 
 
 		 506 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>