More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0393 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  97.69 
 
 		 390 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  81.28 
 
 		 396 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  97.95 
 
 		 390 aa  690    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  81.61 
 
 		 396 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  82.95 
 
 		 392 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 390 aa  778    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  94.62 
 
 		 390 aa  716    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  81.19 
 
 		 401 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  81.19 
 
 		 401 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  80.26 
 
 		 389 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  81.1 
 
 		 391 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  63.49 
 
 		 386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.26 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  65.71 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.86 
 
 		 392 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.91 
 
 		 394 aa  428  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.69 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.35 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.99 
 
 		 403 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.83 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.32 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.99 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.58 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.23 
 
 		 386 aa  348  8e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0962  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.49 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0636992  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.63 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.4 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.16 
 
 		 392 aa  322  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.5 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.5 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.37 
 
 		 384 aa  319  5e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.93 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.75 
 
 		 408 aa  312  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.8 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.38 
 
 		 389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.27 
 
 		 391 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.08 
 
 		 391 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.34 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02875  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.41 
 
 		 379 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.51 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.86 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.59 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.72 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.4 
 
 		 385 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.55 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.11 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.25 
 
 		 411 aa  299  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  41.62 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.84 
 
 		 385 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.44 
 
 		 385 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.59 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.84 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.35 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.52 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.73 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.22 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.87 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  40.83 
 
 		 382 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.1 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.06 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  43.57 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.12 
 
 		 392 aa  289  6e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.28 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.16 
 
 		 384 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.47 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.16 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.88 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.28 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  39.73 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.88 
 
 		 384 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.46 
 
 		 394 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.59 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.21 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.33 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.59 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  47.59 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.38 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.59 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.16 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.27 
 
 		 397 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.34 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.84 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3828  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.54 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.89 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.89 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  40.7 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.29 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.89 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.45 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2739  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.08 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1312  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.9 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>