130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0358 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0358  putative acyltransferase  100 
 
 
295 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34735  normal  0.269668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0355  putative acyltransferase  98.98 
 
 
295 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0332  putative acyltransferase  97.62 
 
 
295 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244482  normal  0.228044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4873  putative acyltransferase  96.26 
 
 
295 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.489512  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5198  putative acyltransferase  78.98 
 
 
306 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0452  acyltransferase family protein  77.82 
 
 
299 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.621143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4724  putative acyltransferase  76.53 
 
 
307 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06030  putative acyltransferase  76.3 
 
 
295 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.015465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0566  putative acyltransferase  76.3 
 
 
295 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4125  putative acyltransferase  70.75 
 
 
296 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05860  putative acyltransferase  64.59 
 
 
295 aa  353  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1168  acyltransferase family protein  48.62 
 
 
307 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4686  putative acyltransferase  49.15 
 
 
304 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53490  putative acyltransferase  49.49 
 
 
304 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3794  putative acyltransferase  46.69 
 
 
317 aa  285  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1006  putative acyltransferase  47.24 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829221  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0879  putative acyltransferase  50.37 
 
 
300 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2692  putative acyltransferase  50 
 
 
299 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0844158  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03628  putative acyltransferase  45.42 
 
 
304 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4055  putative acyltransferase  46.08 
 
 
300 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0029965  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2744  putative acyltransferase  49.44 
 
 
305 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.244294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3640  putative acyltransferase  44.14 
 
 
298 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0417  putative acyltransferase  42.96 
 
 
298 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4017  putative acyltransferase  44.33 
 
 
300 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3941  putative acyltransferase  44.64 
 
 
298 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4830  putative acyltransferase  45.17 
 
 
303 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4043  putative acyltransferase  43.94 
 
 
300 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4136  putative acyltransferase  44.29 
 
 
298 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1162  putative acyltransferase  48.14 
 
 
300 aa  265  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.389136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0348  putative acyltransferase  44.29 
 
 
300 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3646  putative acyltransferase  48.92 
 
 
298 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3625  putative acyltransferase  44.41 
 
 
300 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0319  putative acyltransferase  44.41 
 
 
300 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3422  putative acyltransferase  43.01 
 
 
299 aa  262  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02093  putative acyltransferase  45.26 
 
 
300 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0330  putative acyltransferase  43.75 
 
 
301 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3821  putative acyltransferase  44.52 
 
 
297 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2870  putative acyltransferase  45.49 
 
 
301 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  hitchhiker  0.00487826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1997  putative acyltransferase  48.19 
 
 
304 aa  259  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4173  putative acyltransferase  44.14 
 
 
302 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2503  putative acyltransferase  44.1 
 
 
303 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0282  putative acyltransferase  43.1 
 
 
294 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.028108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2109  putative acyltransferase  44.1 
 
 
303 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3290  putative acyltransferase  45.27 
 
 
306 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4208  putative acyltransferase  40.47 
 
 
302 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4229  putative acyltransferase  40.47 
 
 
302 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000366045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3942  putative acyltransferase  44.52 
 
 
314 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4279  putative acyltransferase  40.13 
 
 
302 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4137  putative acyltransferase  44.52 
 
 
314 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0409  putative acyltransferase  43.45 
 
 
301 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4386  putative acyltransferase  40.13 
 
 
302 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0215545  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4325  putative acyltransferase  40.13 
 
 
302 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0347  putative acyltransferase  43.21 
 
 
302 aa  248  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4888  putative acyltransferase  42.67 
 
 
296 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514103  hitchhiker  0.000000684246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4044  putative acyltransferase  44.41 
 
 
314 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2486  putative acyltransferase  41.34 
 
 
294 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.400705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0318  putative acyltransferase  43.93 
 
 
313 aa  245  8e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4018  putative acyltransferase  44.07 
 
 
314 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4920  putative acyltransferase  45.52 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3291  putative acyltransferase  42.27 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3641  putative acyltransferase  44.36 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4174  putative acyltransferase  43.31 
 
 
306 aa  242  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3626  putative acyltransferase  43.57 
 
 
313 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4244  putative acyltransferase  38.89 
 
 
318 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00468249  normal  0.164529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03748  predicted endonuclease  38.89 
 
 
310 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.02108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4124  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.89 
 
 
310 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00625279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5303  putative acyltransferase  38.89 
 
 
318 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000210001  normal  0.689009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3822  putative acyltransferase  43.57 
 
 
313 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03697  hypothetical protein  38.89 
 
 
310 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0194734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4086  putative acyltransferase  38.89 
 
 
301 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4380  putative acyltransferase  38.89 
 
 
301 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4153  putative acyltransferase  38.89 
 
 
310 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00244028  hitchhiker  0.0000165224 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0416  putative acyltransferase  42.96 
 
 
301 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0281  putative acyltransferase  43.21 
 
 
315 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0103155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4335  putative acyltransferase  38.89 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0165899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00406  putative acyltransferase  38.97 
 
 
292 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3423  putative acyltransferase  42.16 
 
 
313 aa  235  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0950  putative acyltransferase  39.24 
 
 
297 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002044  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.12 
 
 
292 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0329  putative acyltransferase  41.11 
 
 
316 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03629  putative acyltransferase  51.17 
 
 
297 aa  229  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0920  putative acyltransferase  39.24 
 
 
297 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4056  putative acyltransferase  40.89 
 
 
298 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0720932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0408  putative acyltransferase  43.21 
 
 
307 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1456  putative acyltransferase  44.81 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1316  putative acyltransferase  39.58 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1105  putative acyltransferase  39.58 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0819503 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2088  putative acyltransferase  38.19 
 
 
322 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2147  putative acyltransferase  38.3 
 
 
328 aa  211  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0632358  normal  0.568225 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2169  putative acyltransferase  38.26 
 
 
300 aa  208  7e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.141327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0012  putative acyltransferase  38.26 
 
 
300 aa  208  7e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0043  putative acyltransferase  36.59 
 
 
289 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0148  putative acyltransferase  38.93 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.28872  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2177  putative acyltransferase  38.57 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000219754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1819  putative acyltransferase  38.3 
 
 
305 aa  195  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0991283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3557  putative acyltransferase  30.88 
 
 
326 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.554768  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2708  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.71 
 
 
236 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109904  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0042  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.21 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1988  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.84 
 
 
231 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.19 
 
 
257 aa  48.9  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>