More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0333 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1976  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.23 
 
 
687 aa  929    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0310  oxidoreductase, FMN-binding  99.42 
 
 
686 aa  1415    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019532  hitchhiker  0.00413942 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0058  stachydrine utilization oxidoreductase protein  62.94 
 
 
687 aa  910    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0707  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.23 
 
 
687 aa  929    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3746  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.02 
 
 
680 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0759587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4017  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  80.56 
 
 
686 aa  1166    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0396  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  92.27 
 
 
686 aa  1314    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0474  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.23 
 
 
687 aa  929    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.368918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.32 
 
 
680 aa  668    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4782  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  92.57 
 
 
686 aa  1318    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.63 
 
 
686 aa  909    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697936  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4819  NADH:-lavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.94 
 
 
687 aa  917    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4001  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.02 
 
 
680 aa  684    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.504416  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.23 
 
 
687 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4897  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  98.83 
 
 
686 aa  1410    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616438  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5223  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  94.9 
 
 
686 aa  1363    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493589  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4041  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.02 
 
 
680 aa  687    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117135  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0831  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.23 
 
 
687 aa  929    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0574  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.66 
 
 
687 aa  893    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0743  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.23 
 
 
687 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0331  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  99.42 
 
 
686 aa  1415    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907336  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1865  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  64.1 
 
 
687 aa  937    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.715282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  94.61 
 
 
686 aa  1365    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.37 
 
 
687 aa  889    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467216  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1582  NADH-flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  64.53 
 
 
687 aa  943    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6185  putative FMN oxidoreductase  93.29 
 
 
686 aa  1332    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.4 
 
 
694 aa  1152    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5066  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.68 
 
 
687 aa  941    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671736  normal  0.0284931 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3549  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.08 
 
 
687 aa  890    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3286  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.23 
 
 
687 aa  890    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.88 
 
 
688 aa  1149    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388153  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.37 
 
 
687 aa  890    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231835  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5203  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.37 
 
 
687 aa  892    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71260  putative FMN oxidoreductase  93.44 
 
 
686 aa  1333    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.73 
 
 
678 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.23 
 
 
687 aa  890    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
686 aa  1422    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.23 
 
 
687 aa  932    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3398  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.56 
 
 
680 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1003  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.23 
 
 
687 aa  929    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3207  hypothetical protein  42.71 
 
 
678 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.519422 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4887  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.92 
 
 
702 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4753  N-methylproline demethylase, putative  42.13 
 
 
678 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1197  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.71 
 
 
678 aa  548  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.415933  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.4 
 
 
678 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1528  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.24 
 
 
681 aa  544  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.124714 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.69 
 
 
678 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309437  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.19 
 
 
681 aa  521  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3416  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.55 
 
 
678 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623509  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.62 
 
 
677 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.21 
 
 
686 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632121  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.16 
 
 
684 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5525  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.61 
 
 
686 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215393  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3681  putative NADH-dependent oxidase  42.12 
 
 
688 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0197334  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5465  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.12 
 
 
690 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663425  normal  0.914634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2254  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.48 
 
 
664 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4278  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.75 
 
 
661 aa  353  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3631  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.94 
 
 
650 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3558  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.49 
 
 
653 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.102726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2869  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.1 
 
 
650 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2820  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.1 
 
 
650 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5721  putative oxidoreductase  31 
 
 
648 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3861  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.11 
 
 
651 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65940  putative oxidoreductase  30.86 
 
 
648 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2912  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.82 
 
 
650 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1844  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.96 
 
 
671 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.88 
 
 
646 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.85 
 
 
646 aa  288  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.33 
 
 
665 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.05 
 
 
668 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.28 
 
 
652 aa  283  9e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.06 
 
 
654 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.69 
 
 
644 aa  278  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.56 
 
 
635 aa  276  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.691445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.03 
 
 
667 aa  276  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1488  NADH:flavin oxidoreductase  32.34 
 
 
656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4536  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.76 
 
 
682 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.519189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3142  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.57 
 
 
645 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0797  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.53 
 
 
676 aa  270  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369713  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4819  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.17 
 
 
661 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.45 
 
 
725 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.16 
 
 
671 aa  268  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5997  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  32 
 
 
667 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  29.53 
 
 
650 aa  261  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3539  2,4-dienoyl-CoA reductase  30.06 
 
 
673 aa  259  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.19 
 
 
669 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.26 
 
 
670 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4279  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.68 
 
 
647 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02950  2,4-dienoyl-CoA reductase, NADH and FMN-linked  29.08 
 
 
672 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0620  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.08 
 
 
672 aa  257  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0619  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.08 
 
 
672 aa  257  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02900  hypothetical protein  29.08 
 
 
672 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4931  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.54 
 
 
641 aa  257  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1303  NADH:flavin oxidoreductase  31.63 
 
 
671 aa  257  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292118  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2296  hypothetical protein  31.54 
 
 
674 aa  256  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.81 
 
 
671 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00189686  normal  0.0287247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1515  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.45 
 
 
686 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556111  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3263  2,4-dienoyl-CoA reductase  28.93 
 
 
672 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3576  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.93 
 
 
672 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.265601 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2269  hypothetical protein  31.33 
 
 
674 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>