168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0265 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4971  TOBE domain-containing protein  100 
 
 		 71 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0185371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0265  TOBE domain-containing protein  100 
 
 		 71 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0241  TOBE domain protein  98.59 
 
 		 71 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252493  normal  0.0167291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0256  TOBE domain-containing protein  98.59 
 
 		 71 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0359931  normal  0.02055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19590  putative molybdopterin-binding protein  94.37 
 
 		 71 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1686  putative molybdopterin-binding protein  94.37 
 
 		 71 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5313  molybdenum-pterin binding domain protein  91.55 
 
 		 71 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4873  molybdenum-pterin binding protein  91.55 
 
 		 71 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5410  molybdenum-pterin binding protein  91.55 
 
 		 71 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  hitchhiker  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4319  TOBE domain-containing protein  90.14 
 
 		 90 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2490  molybdenum-pterin binding protein  77.46 
 
 		 71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1466  molybdenum-pterin binding  77.46 
 
 		 71 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0340252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2971  TOBE domain protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1487  TOBE domain-containing protein  77.46 
 
 		 71 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1667  TOBE domain-containing protein  77.46 
 
 		 71 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000784196  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1646  TOBE domain-containing protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285785  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1747  TOBE domain protein  78.87 
 
 		 71 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1839  molybdenum-pterin binding protein  76.06 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1236  molybdenum-pterin binding protein, putative  76.06 
 
 		 71 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1993  molybdenum-pterin binding protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1722  putative molybdenum-pterin binding protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0379  putative molybdenum-pterin binding protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0391614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1824  molybdenum-pterin binding protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0782  putative molybdenum-pterin binding protein  76.06 
 
 		 71 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1774  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  74.65 
 
 		 71 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448602  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2498  molybdenum-pterin binding protein, putative  74.65 
 
 		 71 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1085  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  76.06 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1565  molybdenum-pterin binding  76.06 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.239605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  74.65 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1541  TOBE domain-containing protein  76.06 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00697531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  73.24 
 
 		 71 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1973  molybdenum-pterin binding protein  70.42 
 
 		 71 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4707  molybdenum-pterin binding protein  76.06 
 
 		 71 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0618  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  73.24 
 
 		 71 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000430997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  73.24 
 
 		 71 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  73.24 
 
 		 71 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  74.65 
 
 		 71 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0119  molybdenum-pterin binding protein II  77.78 
 
 		 72 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148673  hitchhiker  0.000165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2415  TOBE domain-containing protein  78.26 
 
 		 74 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  56.25 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  56.25 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2003  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  49.23 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2011  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.673987  normal  0.933043 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  48.48 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  41.94 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  46.97 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0274  TOBE domain protein  46.15 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0234749 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  45.45 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  42.65 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  39.06 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 269 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  41.94 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  40.32 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3338  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  38.71 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  36.36 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  42.37 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1576  TOBE domain protein  36.92 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  35.38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  35.38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3442  TOBE domain protein  44.62 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.650149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  45.45 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  39.06 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5200  TOBE domain protein  36.92 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1711  hypothetical protein  34.92 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1586  TOBE domain protein  43.08 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0327768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  36.92 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  45.31 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  34.29 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  40 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  44.62 
 
 		 378 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  46.15 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3636  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1559  molybdenum-pterin binding protein  44.62 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0856932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  35.48 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  39.06 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  41.94 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0855  molybdenum-pterin binding protein  36.92 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  39.39 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  40.32 
 
 		 263 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0168  TOBE domain protein  31.25 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  40.32 
 
 		 263 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  44.62 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 279 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2652  TOBE domain protein  40 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 279 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  40.32 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1546  TOBE domain-containing protein  38.46 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121614  hitchhiker  0.000827182 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  43.75 
 
 		 263 aa  45.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1903  TOBE domain-containing protein  38.46 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0416  TOBE domain-containing protein  35.38 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  38.46 
 
 		 262 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 262 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1598  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00386409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2845  TOBE domain protein  41.54 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1632  TOBE domain-containing protein  40 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2622  TOBE domain-containing protein  41.54 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.142109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>