More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0255 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 279 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.06 
 
 		 279 aa  520  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.42 
 
 		 279 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.55 
 
 		 279 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  80.63 
 
 		 279 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  80.88 
 
 		 285 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  62.72 
 
 		 279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  60.71 
 
 		 284 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  60.71 
 
 		 284 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  60.71 
 
 		 284 aa  323  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  68.86 
 
 		 275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  65.13 
 
 		 275 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  65.25 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  65.25 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  64.75 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  65.25 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.37 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  64.37 
 
 		 275 aa  297  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  64.37 
 
 		 275 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  65.64 
 
 		 275 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  63.44 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  61.32 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  63.44 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  64 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  63.41 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  64 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  63.44 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  64 
 
 		 283 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  61.69 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  59.84 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.09 
 
 		 275 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  52.65 
 
 		 306 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.89 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.19 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.12 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.67 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  50.79 
 
 		 330 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  50.17 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  50.88 
 
 		 289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.32 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.15 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.13 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  49.11 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  52.73 
 
 		 261 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 		 321 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.85 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.41 
 
 		 412 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.61 
 
 		 321 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.71 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.61 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.38 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 		 284 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.7 
 
 		 430 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.82 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  41.35 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  43.03 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.7 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.14 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  38.82 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  38.4 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  34.87 
 
 		 279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 		 273 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0116  membrane protein  39.92 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0935043  hitchhiker  0.000854026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  36.97 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 		 276 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  39.24 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.25 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  35.71 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  38.91 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>