More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0228 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  95.86 
 
 		 145 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  95.17 
 
 		 145 aa  283  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  93.1 
 
 		 145 aa  276  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  73.1 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  72.41 
 
 		 144 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  71.23 
 
 		 146 aa  213  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  72.6 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  67.81 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  60 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  59.31 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  59.03 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  57.24 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  59.44 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  58.74 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  58.74 
 
 		 153 aa  166  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  58.74 
 
 		 153 aa  166  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  58.74 
 
 		 153 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  57.93 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  58.04 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  56.94 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  56.55 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  55.56 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  55.56 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  52.11 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  54.48 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  55.94 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  55.94 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  53.85 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  55.24 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  55.24 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  55.24 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  55.24 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  55.24 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  55.24 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  55.24 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  53.1 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  50.69 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  52.41 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  50.7 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  46.92 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  50 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  49.31 
 
 		 146 aa  143  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  49.3 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  47.89 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  50.68 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  47.22 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  52.59 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  44.29 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  44.44 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  45.07 
 
 		 142 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  42.45 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  43.75 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  42.07 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  58 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  42.25 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  41.96 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  38.6 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  40.43 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.43 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  35.29 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  39.01 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  36.73 
 
 		 182 aa  97.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  40.43 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  40.43 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  40.14 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  43.07 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  38.73 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  39.44 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  37.41 
 
 		 177 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  37.86 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  36.88 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  41.73 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  41.43 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  34.85 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  41.13 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  39.72 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.21 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.61 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  39.72 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  37.32 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  40.91 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  39.72 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  43.94 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  36.88 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  34.75 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  35.46 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32.81 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  39.25 
 
 		 688 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  39.53 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  41.13 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  37.76 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>