273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0188 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  94.98 
 
 		 299 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  93.98 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  91.97 
 
 		 299 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  89.75 
 
 		 298 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  80.43 
 
 		 295 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  76.01 
 
 		 298 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  77.94 
 
 		 298 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  70.37 
 
 		 302 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  71.08 
 
 		 291 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  72.08 
 
 		 304 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  70.28 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  68.9 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  70.28 
 
 		 308 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  68.12 
 
 		 302 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  68.9 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  68.9 
 
 		 308 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  66.22 
 
 		 308 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  70.22 
 
 		 273 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  62.58 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  66.2 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  63.25 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  57.05 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  58.51 
 
 		 301 aa  332  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  56.04 
 
 		 300 aa  331  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  40.57 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  39.58 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  38.11 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  39.1 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  39.44 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 277 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  37.86 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  37.86 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  37.86 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  37.86 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  37.86 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  37.86 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  37.63 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  37.02 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  37.28 
 
 		 283 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  37.37 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  38.35 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  37.02 
 
 		 277 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.92 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  37.17 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  34.83 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  36.88 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  34.16 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.54 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  35.07 
 
 		 281 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  35.09 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  36.62 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.71 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  37.89 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  36.97 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  34.86 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  34.88 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  34.86 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  34.86 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  33.22 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  35.23 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  34.86 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  34.86 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  34.03 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  34.03 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  36.62 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  36.67 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  34.51 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  33.68 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  33.56 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  37.45 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  35.61 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  35.29 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  35.29 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  35.29 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  35.29 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  35.29 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  35.29 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  35.29 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  34.35 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  33.45 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  33.45 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.96 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  33.45 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  35.19 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  36.33 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  37.19 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  36.43 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  34.6 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  34.38 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  32.98 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.44 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>