56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0155 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  100 
 
 		 211 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  91.94 
 
 		 211 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  91 
 
 		 211 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  82.29 
 
 		 207 aa  317  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  63.55 
 
 		 208 aa  244  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  54.81 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  56.32 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  51.09 
 
 		 199 aa  187  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  47.72 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  46.3 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  40.21 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  34.12 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  38.62 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  29 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  28.12 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  28.12 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  30.41 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  31.25 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  25.64 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  33.61 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  33.61 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.59 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30.77 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  26.4 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  25.26 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  26.11 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  26.4 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  25.71 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  25.71 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  24.86 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  25.17 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  25.13 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 		 398 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  33.33 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  22.86 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  21.05 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  25.68 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  29.68 
 
 		 367 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  25.97 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  29.17 
 
 		 367 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  23.28 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  25.52 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  27.07 
 
 		 390 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  26.03 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  22.16 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  23.13 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  24.81 
 
 		 390 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  23.29 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  26.55 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  23.13 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  21.6 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  29.56 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.03 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  29.56 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>