20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0107 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  100 
 
 		 137 aa  286  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  92.7 
 
 		 137 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  91.97 
 
 		 137 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  87.59 
 
 		 137 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  65 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  57.97 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  57.97 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  49.57 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  35.77 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  39.06 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  38.28 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  37.5 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  34.92 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  35.16 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  34.92 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  32.74 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  32.74 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>