20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0106 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  97.81 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  95.62 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  94.16 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  53.23 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  52.9 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  51.49 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  47.14 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  53.98 
 
 		 139 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  50.85 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  39.53 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  38.28 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  39.06 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  38.79 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  39.2 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  38.89 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  38.89 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>