29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0102 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000505882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0087  hypothetical protein  97.26 
 
 		 87 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0105  hypothetical protein  89.04 
 
 		 73 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0099  hypothetical protein  75.68 
 
 		 74 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0154  hypothetical protein  66.22 
 
 		 74 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0038  hypothetical protein  66.22 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0041  hypothetical protein  64.86 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00480  hypothetical protein  63.51 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4456  hypothetical protein  53.33 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0151  hypothetical protein  51.32 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0041  hypothetical protein  52.7 
 
 		 77 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00720  hypothetical protein  53.42 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0105  hypothetical protein  49.33 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0090  hypothetical protein  46.67 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0108  hypothetical protein  48 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72225  hitchhiker  0.00358532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0060  hypothetical protein  47.37 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0105  hypothetical protein  45.33 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01140  hypothetical protein  49.33 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.147153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0096  hypothetical protein  41.56 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1866  putative lipoprotein  44.59 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.380587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1978  hypothetical protein  44.59 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2124  hypothetical protein  38.71 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3604  hypothetical protein  43.06 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.476197  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3978  protein of unknown function DUF1161  41.18 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.234117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2348  protein of unknown function DUF1161  41.67 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0734587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2047  hypothetical protein  40.54 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.58796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2287  hypothetical protein  41.67 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581358  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1926  hypothetical protein  33.78 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>