More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0081 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  75.71 
 
 
457 aa  680  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  85.12 
 
 
457 aa  793  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  85.56 
 
 
457 aa  805  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  68.93 
 
 
457 aa  646  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  91.27 
 
 
458 aa  849  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  98.25 
 
 
457 aa  905  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  5.49949e-09 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  99.56 
 
 
457 aa  913  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  99.78 
 
 
457 aa  915  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  4.48887e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  86.87 
 
 
457 aa  818  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  85.12 
 
 
457 aa  775  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  85.56 
 
 
457 aa  807  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 
457 aa  917  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  1.77319e-11 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  85.56 
 
 
457 aa  800  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  67.3 
 
 
477 aa  631  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  67.03 
 
 
458 aa  625  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  65.86 
 
 
457 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  66.17 
 
 
467 aa  608  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  63.76 
 
 
458 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  64.19 
 
 
458 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  63.1 
 
 
458 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  8.65676e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  62.45 
 
 
458 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  61.57 
 
 
458 aa  586  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  63.32 
 
 
458 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  63.32 
 
 
458 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  63.1 
 
 
458 aa  587  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  63.1 
 
 
458 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  62.45 
 
 
458 aa  587  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  62.66 
 
 
458 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  63.32 
 
 
458 aa  586  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  63.1 
 
 
458 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  62.45 
 
 
458 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  63.1 
 
 
458 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  63.32 
 
 
458 aa  586  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  63.32 
 
 
458 aa  586  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  63.1 
 
 
458 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  63.1 
 
 
458 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  63.32 
 
 
458 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  63.32 
 
 
458 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  63.32 
 
 
458 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  63.1 
 
 
458 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  63.32 
 
 
458 aa  586  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  64.19 
 
 
458 aa  583  1e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  67.03 
 
 
459 aa  581  1e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  63.76 
 
 
458 aa  581  1e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  63.33 
 
 
469 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  61.57 
 
 
458 aa  578  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  62.9 
 
 
469 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  63.33 
 
 
469 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  6.89203e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  63.33 
 
 
469 aa  581  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  63.33 
 
 
469 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  63.11 
 
 
469 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  63.33 
 
 
469 aa  577  1e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  62.47 
 
 
469 aa  576  1e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  62.9 
 
 
469 aa  577  1e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  62.69 
 
 
469 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.83519e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  62.69 
 
 
469 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  62.05 
 
 
469 aa  572  1e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  62.14 
 
 
457 aa  572  1e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  62.69 
 
 
469 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  62.69 
 
 
469 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  61.83 
 
 
469 aa  572  1e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  62.05 
 
 
469 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  65.28 
 
 
459 aa  566  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  57.64 
 
 
458 aa  552  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  60.18 
 
 
457 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  61.35 
 
 
458 aa  547  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  58.33 
 
 
459 aa  540  1e-152  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2079  TrkA-N domain protein  60.04 
 
 
458 aa  538  1e-152  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  57.17 
 
 
467 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  56.54 
 
 
457 aa  512  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  53.71 
 
 
458 aa  500  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  51.97 
 
 
465 aa  465  1e-130  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4070  potassium transporter peripheral membrane component  51.28 
 
 
471 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01925e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  48.04 
 
 
485 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  46.75 
 
 
492 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  47.52 
 
 
484 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  47.52 
 
 
484 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  41.34 
 
 
458 aa  352  9e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  41.56 
 
 
458 aa  348  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  41.99 
 
 
458 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  39.83 
 
 
458 aa  338  1e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  41.99 
 
 
458 aa  338  2e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  41.99 
 
 
458 aa  336  6e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  41.77 
 
 
458 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  39.18 
 
 
458 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  38.86 
 
 
454 aa  320  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  40.91 
 
 
458 aa  317  3e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  37.88 
 
 
458 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  37.99 
 
 
453 aa  309  7e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  38.83 
 
 
457 aa  307  2e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  37.23 
 
 
458 aa  303  5e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  37.23 
 
 
458 aa  303  5e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  36.68 
 
 
465 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  35.93 
 
 
458 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  36.93 
 
 
458 aa  289  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  37.2 
 
 
458 aa  286  6e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  36.44 
 
 
450 aa  285  1e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  35.46 
 
 
452 aa  270  3e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1358  potassium transporter peripheral membrane component  37.37 
 
 
458 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  35.84 
 
 
450 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>