34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0041 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0027  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  227  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0044  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  226  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.185478  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0041  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  226  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0041  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  226  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0567  hypothetical protein  67.24 
 
 		 116 aa  171  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4389  hypothetical protein  62.07 
 
 		 116 aa  156  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487019 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0643  hypothetical protein  68.1 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06048  hypothetical protein  58.62 
 
 		 116 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001367  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  58.26 
 
 		 116 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2024  hypothetical protein  65.52 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1833  hypothetical protein  64.66 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1797  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.0320282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0446  hypothetical protein  45.69 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1782  hypothetical protein  40.52 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4986  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0420  hypothetical protein  40.54 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0359883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2100  hypothetical protein  32.76 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1918  hypothetical protein  43.59 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1346  hypothetical protein  59.02 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2175  hypothetical protein  40.2 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3375  hypothetical protein  32.79 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000793072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0823  hypothetical protein  32.39 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0892  hypothetical protein  37.29 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1622  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1583  hypothetical protein  33.93 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1798  hypothetical protein  33.93 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1825  hypothetical protein  33.93 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1574  hypothetical protein  33.93 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1404  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.230162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1622  hypothetical protein  33.93 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1879  hypothetical protein  33.93 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1764  hypothetical protein  33.93 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3578  hypothetical protein  33.93 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1748  hypothetical protein  33.93 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>