15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0033 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  99.71 
 
 		 344 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  823    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  26.45 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  34.07 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2639  hypothetical protein  27.81 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  34.07 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  21.52 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0554  hypothetical protein  25.19 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0136677  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3007  hypothetical protein  27.99 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.673952 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  23.58 
 
 		 244 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1511  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.85 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189889 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03060  histidine kinase  23.95 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00100507  hitchhiker  2.5063000000000002e-30 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3153  hypothetical protein  26.79 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>