33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0027 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0026  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  186  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834973  hitchhiker  0.00036673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0025  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  186  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.699949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0027  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  186  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5390  hypothetical protein  97.8 
 
 		 91 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0426586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1465  hypothetical protein  67.39 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0420  hypothetical protein  75.41 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1175  hypothetical protein  62.07 
 
 		 96 aa  87.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2342  hypothetical protein  68.85 
 
 		 104 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2714  hypothetical protein  60.98 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000197127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4518  hypothetical protein  65.52 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2194  hypothetical protein  63.16 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0447  hypothetical protein  64.58 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3869  hypothetical protein  48.53 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4143  hypothetical protein  44.3 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2230  hypothetical protein  41.18 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1656  hypothetical protein  49.25 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000173023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5296  hypothetical protein  49.25 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3971  hypothetical protein  59.18 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2276  hypothetical protein  52.73 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2711  hypothetical protein  48.21 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1936  hypothetical protein  44.58 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1254  hypothetical protein  78 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4539  hypothetical protein  77.08 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4886  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1073  hypothetical protein  50.98 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1644  hypothetical protein  47.17 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1468  hypothetical protein  48 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3974  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891922  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6005  hypothetical protein  53.62 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1491  hypothetical protein  43.06 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1383  hypothetical protein  45.83 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0265  hypothetical protein  70.83 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3419  hypothetical protein  70.83 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>