27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0010 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1314    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1314    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1314    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1314    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  23.24 
 
 		 567 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  22.67 
 
 		 628 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  30.22 
 
 		 694 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  21.09 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  26.57 
 
 		 322 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  36.23 
 
 		 378 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  36.23 
 
 		 378 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3363  hypothetical protein  24.93 
 
 		 329 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  36.36 
 
 		 397 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  23.6 
 
 		 609 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  26.74 
 
 		 433 aa  51.2  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1629  hypothetical protein  28.68 
 
 		 506 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  27.27 
 
 		 504 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  27.61 
 
 		 363 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  35.21 
 
 		 307 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  29.01 
 
 		 366 aa  47.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  27.81 
 
 		 342 aa  47.4  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  32.46 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0017  hypothetical protein  29.09 
 
 		 503 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  23.33 
 
 		 597 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  47.22 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2983  hypothetical protein  27.12 
 
 		 167 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  22.86 
 
 		 661 aa  43.9  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>