More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0052 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0013  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0034  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0046  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0032  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0119257  normal  0.670174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0052  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0013  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0119522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0044  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.541664  hitchhiker  0.000000158432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0049  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000677236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0015  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0358184  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0014  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634933  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0064  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.801657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0032  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0007  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0050  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.903687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0055  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0003  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0022  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0054  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0077  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0013  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0058  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.819419 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0030  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.284622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0083  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0076  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0023  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0034  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000978021  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0080  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0025  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0529629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0009  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292395  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000540506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt023  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00025586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0027  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0066  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00138372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0033  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0654  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1372  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0013  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0742  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0004  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108101  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0020  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.71083e-16  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0029  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000220959  unclonable  0.000000053075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0041  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000493148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0067  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00925323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0040  tRNA-Ala  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0690466  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0050  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0022  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000459218  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0052  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0080  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4325  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00976587  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4349  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271842  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4354  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.118152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0038  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0065  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0051  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0057  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0063  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0059  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0004  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0057  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0016  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0003  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0065  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0028  tRNA-Ala  93.22 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt02  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0068  tRNA-Ala  93.22 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>