191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3836 on replicon NC_008608
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 
96 aa  196  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  74.19 
 
 
94 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  61.54 
 
 
107 aa  124  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  70.97 
 
 
72 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  55.68 
 
 
100 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  55.68 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  55.68 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  54.88 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  50.54 
 
 
98 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.41 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.74 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.66 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  52.81 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  53.75 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  49.46 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  50 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.24 
 
 
95 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  54.12 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.14 
 
 
96 aa  88.6  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.38 
 
 
91 aa  87  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.38 
 
 
91 aa  87  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  53.09 
 
 
97 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.38 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  52.27 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.38 
 
 
93 aa  84.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  49.41 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  46.15 
 
 
108 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  47.31 
 
 
95 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  49.41 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.19 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.63 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.54 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.86 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.57 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.75 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.3 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  42.53 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.86 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.17 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.71 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.95 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  47.89 
 
 
1365 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2425  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.38 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.22 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3127  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  40.74 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.273977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  43.59 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0576  addiction module antidote protein, HigA family  40.74 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0418  addiction module antidote protein, HigA family  40.74 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.59 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.96 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.74 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0484556  unclonable  0.0000000122724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0560  addiction module antidote protein  40.74 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0522  addiction module antidote protein  40.74 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00434  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.74 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  45.95 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00439  hypothetical protein  40.74 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.53 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.82 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4314  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.16 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.77 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.59 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  41.03 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  40.85 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2524  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.44 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0379048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.37 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.56 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2852  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.35 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674074  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  38.64 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.74 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.62 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.67 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  36.67 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  36.67 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  36.67 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3183  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.77 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  36.67 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4593  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.83 
 
 
1370 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.387666  normal  0.556972 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  36.67 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  36.67 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3935  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.28 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0902  hypothetical protein  34.94 
 
 
199 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  34.88 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.96 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.31 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390775  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2106  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 
93 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  35.87 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.24 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.09 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.54 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.543418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>