141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3833 on replicon NC_008608
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  94.26 
 
 		 401 aa  768    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  79.35 
 
 		 401 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  85.04 
 
 		 401 aa  699    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  805    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  805    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  88.03 
 
 		 401 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  805    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  97.01 
 
 		 401 aa  785    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  84.75 
 
 		 399 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  85 
 
 		 399 aa  684    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  99.25 
 
 		 401 aa  799    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  85.04 
 
 		 401 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  74.31 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  77.31 
 
 		 399 aa  598  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  72.82 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  73.82 
 
 		 400 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  72.32 
 
 		 400 aa  564  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  73.57 
 
 		 397 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  73.82 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  70.73 
 
 		 406 aa  547  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  73.32 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  73.07 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  41.83 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  40.8 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  41.83 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  43.42 
 
 		 399 aa  298  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  41.83 
 
 		 400 aa  289  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  38.97 
 
 		 400 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  38.9 
 
 		 377 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  39.5 
 
 		 380 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  35.73 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  34.59 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  25.94 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.06 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  23.28 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  23.28 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  23.72 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  23.28 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  23.28 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  23.28 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  26.6 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  23.04 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  23.04 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  25.37 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  28.95 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  21.81 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  20.81 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  20.81 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  21.63 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.32 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  30.46 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  22.45 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  26.04 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  30.18 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  26.9 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.41 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  22.46 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  19.76 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  24.46 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  29.14 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  32.35 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  23.57 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  25.95 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  23.6 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  23.6 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  27.41 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  26.09 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  21.94 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  20.96 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  25.71 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  33.04 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 855 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  22.19 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.32 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  23.91 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  29.73 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.12 
 
 		 809 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  28.33 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  35.45 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  32.46 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  23.15 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.11 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  33.04 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>