199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3806 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  302  9.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 167 aa  207  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1305  MucR family transcriptional regulator  59.03 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192509  normal  0.0470135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 189 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  57.97 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1173  transcriptional regulator, MucR family  56.3 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.2669100000000005e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3088  transcriptional regulator, MucR family  55.56 
 
 		 169 aa  148  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000560942  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1863  Ros/MucR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 167 aa  146  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000224097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  53.52 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  50 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  50 
 
 		 186 aa  144  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  52.11 
 
 		 177 aa  143  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  51.45 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  51.45 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  37.31 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  37.31 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  37.5 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2289  MucR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.365964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  36.72 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  36.72 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  33.08 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  34.38 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  34.92 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  37.12 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  34.62 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  36.8 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  34 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  34.65 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1774  MucR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.0107118 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  34.65 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  33.09 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  32 
 
 		 175 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  30.83 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  32 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  32 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  34.09 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  33.06 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  32.88 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  30.6 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  35.2 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  34.51 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3611  MucR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  31.82 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  35.82 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0997  MucR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  34.33 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  34.88 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  34.88 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  32.5 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  32 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>