215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3729 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  100 
 
 		 317 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  56.81 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.35 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  32.35 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  34.48 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  32.03 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  31.38 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  31.76 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  31.45 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.8 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  29.92 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  26.69 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  30.45 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.39 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  27.07 
 
 		 328 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  27.07 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.98 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.37 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.64 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.77 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  27.97 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.44 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.67 
 
 		 331 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.01 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.01 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.54 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  27.17 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.43 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.43 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.43 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.97 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.44 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.48 
 
 		 343 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.44 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.16 
 
 		 332 aa  89.4  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.67 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.07 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  25.91 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.34 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.46 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.52 
 
 		 364 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.43 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.84 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.2 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.52 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.52 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  29.86 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.97 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.11 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  24.85 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.91 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  24.84 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  28.23 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  25.88 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.43 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  25.65 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.16 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  26.3 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  26.73 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  28.71 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  25.37 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  30.27 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  30.27 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.75 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  24.91 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.93 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  30.27 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  26.15 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  29.12 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  27.31 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.06 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.34 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  28.18 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  25.53 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.34 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  25.63 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  27.27 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.9 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  26.11 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  25.46 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.14 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  27.27 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.4 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  25.71 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  28.57 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  25.13 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  25.13 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  27.47 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  26.52 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.13 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  27.09 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  27.24 
 
 		 4917 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  26.79 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  25.6 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  25.71 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  26.21 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  26.18 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.82 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.73 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>