More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3710 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 419 aa  849    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  68.26 
 
 		 419 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  58.95 
 
 		 419 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  59.67 
 
 		 419 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  49.16 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  30.88 
 
 		 427 aa  173  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  34.23 
 
 		 445 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  33.99 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  35.26 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 441 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 467 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  27.33 
 
 		 462 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.52 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  30.15 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 496 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 424 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  29.63 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.85 
 
 		 462 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 463 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 423 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.08 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  28.34 
 
 		 576 aa  112  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.5 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 441 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 1496 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 		 488 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27.21 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.87 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1361  Outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.824117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  26.57 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 476 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  25.72 
 
 		 472 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 449 aa  96.3  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1470 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.36 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  24.77 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 444 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  24.57 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 513 aa  94  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0494  FusA/NodT family protein  27.89 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.690015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.47 
 
 		 480 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 442 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 514 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  25.29 
 
 		 438 aa  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 442 aa  89.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 435 aa  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 514 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 514 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.51 
 
 		 482 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.85 
 
 		 479 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 476 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 476 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  25.06 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  26.45 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.36 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  25.65 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.22 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  26.14 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  25.92 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  27.69 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  23.23 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.9 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.85 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 515 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  28.75 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.35 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.25 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 519 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.04 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.39 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>