More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3691 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  74.57 
 
 		 232 aa  353  8.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.84 
 
 		 233 aa  257  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 231 aa  234  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.66 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.21 
 
 		 240 aa  214  8e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 236 aa  214  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  45.13 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2327  two-component response regulator  44.54 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.82 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.82 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  41.33 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 321 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.46 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.33 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  41.56 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  40.27 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.6 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.6 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  40.44 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.6 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  38.91 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  40.69 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.46 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  38.91 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0234  response regulator receiver  39.56 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.46 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>