More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3670 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  71.58 
 
 
190 aa  267  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  68.65 
 
 
190 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  69.95 
 
 
185 aa  251  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  65.76 
 
 
184 aa  251  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  65.03 
 
 
189 aa  245  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  58.79 
 
 
186 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  58.99 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  56.74 
 
 
185 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  57.3 
 
 
186 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  51.91 
 
 
187 aa  191  7e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  52.49 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  52.49 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  53.11 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  53.07 
 
 
205 aa  178  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 
185 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  48.86 
 
 
198 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  44.92 
 
 
196 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 
188 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  44.92 
 
 
196 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 
192 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  52.67 
 
 
154 aa  150  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  47.19 
 
 
180 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  42.05 
 
 
188 aa  147  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  44.63 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  43.26 
 
 
201 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  44.63 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  43.18 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  40.91 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  48.6 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 
188 aa  144  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.05 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  46.37 
 
 
183 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 
185 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 
185 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  43.43 
 
 
181 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 
185 aa  141  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 
188 aa  141  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  40 
 
 
193 aa  141  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 
186 aa  141  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  41.38 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  43.43 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  43.58 
 
 
197 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  45.51 
 
 
185 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 
185 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  47.73 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  41.71 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  44.69 
 
 
196 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  47.78 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  44.13 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.2 
 
 
197 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.24 
 
 
193 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  46.37 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40.33 
 
 
188 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.11 
 
 
228 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 
187 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.52 
 
 
190 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.52 
 
 
187 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.2 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.2 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.2 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 
196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  40.11 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 
186 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  43.85 
 
 
186 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  39.34 
 
 
186 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 
186 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.96 
 
 
188 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  43.48 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  43.26 
 
 
185 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  42.41 
 
 
195 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  48.18 
 
 
309 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  35.23 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  45.32 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  46.04 
 
 
294 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  41.44 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.67 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  45.32 
 
 
326 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.98 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  46.1 
 
 
194 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  45.32 
 
 
294 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40.44 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40.44 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40.44 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36.76 
 
 
201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  45.32 
 
 
183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  45.32 
 
 
293 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  45.32 
 
 
298 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  43.97 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  44.93 
 
 
181 aa  128  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  38.64 
 
 
179 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  38.04 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>