186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3663 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  66.28 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  63.79 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  53.85 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  66.9 
 
 		 158 aa  208  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  45.71 
 
 		 171 aa  158  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  44.44 
 
 		 169 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  43.17 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  44.08 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  43.45 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  41.53 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  45.14 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  37.08 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  32.76 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  34.08 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  39.04 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  39.19 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  38.73 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  36.69 
 
 		 148 aa  101  8e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  34.25 
 
 		 238 aa  99.4  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  36.99 
 
 		 221 aa  97.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  36.3 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.93 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  35.81 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  35.43 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  32.37 
 
 		 227 aa  92.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  32.58 
 
 		 227 aa  91.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.1 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.59 
 
 		 175 aa  91.3  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  40 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.41 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.49 
 
 		 166 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  33.79 
 
 		 161 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  33.52 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36.13 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  31.43 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  38.1 
 
 		 153 aa  84.7  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.98 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  39.87 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.05 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.76 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  29.56 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  35.03 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.98 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  33.33 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  37.67 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  26.63 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  31.51 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  28.65 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  32.91 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  30.73 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  30.97 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.32 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.37 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  29.48 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  34.01 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.02 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  34.42 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  29.48 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  29.94 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  29.3 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  32.74 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  31.84 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  31.47 
 
 		 134 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  34.67 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  34.67 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  30.92 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.01 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  30.87 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  33.83 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  30.32 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  29.87 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  31.98 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  31.93 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  32.45 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  29.11 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  31.25 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.19 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  33.33 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  33.33 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  27.68 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.1 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  31.33 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  28.18 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  30.5 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  30.5 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  29.61 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  33.08 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  32.85 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  33.81 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  31.21 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  33.33 
 
 		 258 aa  62  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  35.44 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  24.58 
 
 		 282 aa  61.2  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  30.15 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  32.74 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  28.92 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>