More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3644 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  89.14 
 
 		 228 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  84.55 
 
 		 222 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  85 
 
 		 222 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  75.57 
 
 		 234 aa  347  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  74.66 
 
 		 221 aa  336  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0544  ABC transporter related  63.47 
 
 		 219 aa  275  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  56.56 
 
 		 245 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  53.18 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  50.23 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.23 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.77 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.45 
 
 		 251 aa  222  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.36 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  50.23 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  47.96 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  49.32 
 
 		 241 aa  221  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.4 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.86 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  50 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.54 
 
 		 242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  49.09 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.62 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.62 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  50.45 
 
 		 235 aa  218  7e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.82 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  48.4 
 
 		 228 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  50.45 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  48.42 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.18 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  48.86 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  48.86 
 
 		 248 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.58 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  49.1 
 
 		 238 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 240 aa  214  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.03 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.55 
 
 		 239 aa  214  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  48.87 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  48.17 
 
 		 242 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.1 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  44.29 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 		 408 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.49 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  43.84 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  43.38 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  48.64 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  50.46 
 
 		 253 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  49.55 
 
 		 242 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  47.95 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  47.95 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.65 
 
 		 657 aa  211  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  45.91 
 
 		 264 aa  210  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  45.21 
 
 		 654 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  48.4 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  50 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.03 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  47.71 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.17 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.17 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.58 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.79 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.55 
 
 		 646 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  47.03 
 
 		 657 aa  209  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  46.82 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  46.36 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.95 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  48.61 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>