289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3612 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  66.01 
 
 		 154 aa  214  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  63.4 
 
 		 154 aa  209  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  64.71 
 
 		 154 aa  209  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  62.75 
 
 		 153 aa  204  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  64.71 
 
 		 153 aa  196  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  62.09 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  44.52 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  38.61 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  37.82 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  38.46 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 157 aa  123  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  39.35 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  39.74 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  42.58 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  41.45 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  37.34 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  39.87 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  37.97 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  38.22 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  37.42 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  36.08 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  39.87 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  37.42 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 160 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  36.42 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  41.45 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  33.96 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  33.99 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  33.99 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  36.13 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 155 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  41.83 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  35.06 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 177 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  39.47 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  33.55 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  35.48 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  38.71 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  53.26 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  38.16 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  40 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 159 aa  94.4  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 167 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 167 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  35.26 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  37.91 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  34.87 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>