More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3597 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 161 aa  321  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  73.42 
 
 		 162 aa  251  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  65.38 
 
 		 162 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  69.28 
 
 		 160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  62.18 
 
 		 164 aa  198  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  57.96 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  65.22 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  54.17 
 
 		 164 aa  167  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  44.94 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  46.31 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  43.66 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  41.56 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  41.45 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  43.12 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  47.62 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  45.75 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  43.06 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 		 202 aa  114  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  43.7 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  43.36 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  44.54 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  48.87 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  42.41 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 		 171 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  41.14 
 
 		 172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  43.67 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  40.51 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  47.52 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  43.87 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  43.57 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 178 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  41.56 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  42.55 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  39.62 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  42.38 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  43.15 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  40.26 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  39.1 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 176 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  41.43 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>