More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3540 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  833    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  72.86 
 
 		 401 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  69.58 
 
 		 402 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2702  SAM-dependent methyltransferase-like protein  71.61 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000137033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3504  SAM-dependent methyltransferase-like protein  68.69 
 
 		 398 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00331784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  71.61 
 
 		 399 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  62.56 
 
 		 398 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.72 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  38.24 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  35.41 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  35.66 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  35.41 
 
 		 400 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4829  putative RNA methylase  37.72 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  36.8 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  31.83 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  34.2 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  34.12 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  34.2 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  30.65 
 
 		 393 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  33.77 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  33.5 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  33.77 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  33.77 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  31.25 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  35.7 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  33.76 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  32.25 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  33.51 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  33.51 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  33.51 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  36.9 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  33.51 
 
 		 396 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  30.16 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  31.85 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  30.83 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  31.08 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33.68 
 
 		 403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  33.68 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  33.68 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  33.68 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  33.68 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  32.28 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  32.21 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  33.59 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  33.51 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  33.25 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  36.41 
 
 		 391 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  34.06 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  33.51 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  34.06 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  29 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  34.01 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  31.68 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  31.66 
 
 		 393 aa  190  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  35.11 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  31.15 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  33.76 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  29.65 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  32.91 
 
 		 397 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  30.12 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  30.65 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  32.28 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  27.75 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  31.75 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  34.94 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  27.75 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  32.2 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  27.5 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  31.97 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  33.59 
 
 		 396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  27.75 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  27.75 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  33.25 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  27.75 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  33.5 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  27.5 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  27.5 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  33.59 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  27.25 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  28.39 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  31.5 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  34.34 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  32.32 
 
 		 396 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  28.97 
 
 		 394 aa  179  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  33.83 
 
 		 396 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.16 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  28.83 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  28.83 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  34.33 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  27.25 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  32.29 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  34.29 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  32.83 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  32.67 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  33.84 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  34.47 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  34.09 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>