156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3474 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.58 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.44 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.69 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.94 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  46.97 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  50 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 		 347 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  48.44 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 		 326 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  42.19 
 
 		 374 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.62 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 93 aa  50.1  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 211 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.44 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1432  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0567426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1922  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.589844  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1334  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0203428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2519  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.58 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 		 329 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>