More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3445 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 		 446 aa  910    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  67.79 
 
 		 441 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  48.01 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  48.69 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  47.86 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.85 
 
 		 481 aa  345  7e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  40.63 
 
 		 468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  36.79 
 
 		 419 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.91 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.92 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2152  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  31.15 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.4 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.77 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.3 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  32.46 
 
 		 437 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  29.11 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.02 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  31.04 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.62 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2391  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.66 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  40.95 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2694  GTP-binding signal recognition particle  29.11 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  45.79 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  33.99 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  35.14 
 
 		 373 aa  176  8e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.46 
 
 		 373 aa  176  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.91 
 
 		 626 aa  176  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.09 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  42.02 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.7 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.44 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.55 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.55 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.43 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.33 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.49 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.57 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1508  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.06 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0233  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.46 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.09 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0407274  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.76 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.95 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  27.96 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  40.54 
 
 		 381 aa  160  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0074  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.05 
 
 		 481 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.03 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.03 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.03 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.03 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.86 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.86 
 
 		 458 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.5 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0276  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.25 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0377  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.45 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  35.04 
 
 		 356 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.33 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  40.43 
 
 		 466 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  43 
 
 		 484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  44.15 
 
 		 505 aa  153  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  43.35 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.15 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.13 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.14 
 
 		 378 aa  151  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.14 
 
 		 378 aa  151  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1650  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  37.93 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000418792  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.55 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  28.78 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  41.67 
 
 		 585 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  28.51 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.32 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0180  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.69 
 
 		 657 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000220728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.07 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3039  GTP-binding signal recognition particle  38.12 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  38.42 
 
 		 758 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.37 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.03 
 
 		 825 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.34 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.46 
 
 		 513 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.62 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.67 
 
 		 588 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.67 
 
 		 588 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.62 
 
 		 583 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.33 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.38 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.72 
 
 		 804 aa  134  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  39.15 
 
 		 485 aa  133  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.03 
 
 		 583 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.07 
 
 		 435 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.03 
 
 		 583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.03 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1357  GTP-binding signal recognition particle  37.89 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.27 
 
 		 582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.03 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.03 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.03 
 
 		 583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.03 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.56 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.31 
 
 		 615 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  27.13 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.41 
 
 		 632 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>