More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3442 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 264 aa  518  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  63.4 
 
 		 265 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  51.52 
 
 		 264 aa  294  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  51.14 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  49.04 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  50.76 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  50.76 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  39.59 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  35.89 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  32.52 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  37.08 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  35 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  32.66 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  33.46 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  31.62 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  29.64 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  29.73 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  30.12 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  35.47 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  31.25 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  34.58 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  29.71 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  30.86 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  32.35 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  29.88 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  34.76 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  32.64 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  32.64 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  31.36 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  31.19 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  30.09 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  32.52 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  32.13 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  29.65 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  25.2 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  31.19 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  35.06 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  29.65 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  30.53 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30.56 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  30.3 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  29.46 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  30.94 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  28.76 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.87 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  32.75 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  31.14 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  31.14 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  31.14 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.58 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  31.14 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  31.3 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  32.29 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  33.04 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  35.53 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  28.76 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  27.83 
 
 		 247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  29.07 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  29.53 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  30.7 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  32.6 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  32.6 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  28.37 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  30.28 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  30.97 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.16 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  34.35 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  29.88 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  34.35 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  29.88 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  32.14 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  34.35 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  34.35 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  32.16 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  32.59 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  30.7 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  29.11 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  31.11 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  33.04 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  28.46 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  27.75 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  27.67 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  29.73 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.71 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  29.63 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  29.63 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  32.72 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  32.72 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  31.11 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  31.36 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>