More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3418 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  70.36 
 
 
469 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  72.49 
 
 
469 aa  678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  69.72 
 
 
468 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  71.86 
 
 
469 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  100 
 
 
478 aa  970    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  70.36 
 
 
469 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  70.15 
 
 
469 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  48.84 
 
 
488 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  48.39 
 
 
463 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  46.35 
 
 
474 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  41.86 
 
 
475 aa  387  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  42.49 
 
 
470 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  42.68 
 
 
467 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  45.09 
 
 
460 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.31 
 
 
470 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  41.85 
 
 
471 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  43.15 
 
 
490 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  42.64 
 
 
460 aa  361  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  42.86 
 
 
460 aa  360  4e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.72 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  42.13 
 
 
460 aa  356  5e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  41.53 
 
 
471 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  38.38 
 
 
457 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.86 
 
 
472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  41.36 
 
 
460 aa  353  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  40.59 
 
 
486 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.01 
 
 
463 aa  352  8e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  42.41 
 
 
474 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  39.57 
 
 
472 aa  346  6e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.5 
 
 
474 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  43.37 
 
 
472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  43.28 
 
 
477 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.12 
 
 
474 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.59 
 
 
480 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  40.59 
 
 
480 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  38.64 
 
 
475 aa  339  5.9999999999999996e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  38.46 
 
 
467 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  41.79 
 
 
460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  39.57 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  40.72 
 
 
460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  37.58 
 
 
475 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.63 
 
 
472 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  40.54 
 
 
478 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  40.51 
 
 
484 aa  330  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.68 
 
 
475 aa  330  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.42 
 
 
480 aa  329  7e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.14 
 
 
472 aa  329  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  39.17 
 
 
479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.63 
 
 
472 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  37.45 
 
 
458 aa  322  9.999999999999999e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  36.85 
 
 
470 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  36.21 
 
 
470 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  35.78 
 
 
470 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.56 
 
 
470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40.2 
 
 
487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40.95 
 
 
487 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  38.65 
 
 
414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.36 
 
 
467 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.19 
 
 
473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  37.84 
 
 
485 aa  303  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  34.25 
 
 
474 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  38.39 
 
 
409 aa  300  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  37.27 
 
 
486 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  37.8 
 
 
460 aa  297  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  40.58 
 
 
487 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  36.8 
 
 
486 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  34.58 
 
 
486 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  40.21 
 
 
470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  37.1 
 
 
467 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  38.08 
 
 
482 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  35.05 
 
 
733 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  36.77 
 
 
473 aa  272  7e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.87 
 
 
484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  32.92 
 
 
484 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  33.54 
 
 
484 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  32.3 
 
 
484 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.94 
 
 
464 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  34.67 
 
 
503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  33.19 
 
 
465 aa  240  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  29.9 
 
 
501 aa  237  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.33 
 
 
471 aa  229  7e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  33.83 
 
 
468 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.12 
 
 
518 aa  197  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  30.72 
 
 
548 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  31.31 
 
 
548 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0958  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.06 
 
 
574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0757  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.72 
 
 
574 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  30.02 
 
 
548 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  30.92 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0873  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.97 
 
 
564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  29.38 
 
 
550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2943  phosphoglucomutase  30.1 
 
 
550 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  28.63 
 
 
449 aa  171  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  29.48 
 
 
550 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  30.78 
 
 
549 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  27.84 
 
 
548 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  32.42 
 
 
448 aa  170  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  30.84 
 
 
458 aa  170  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  28.68 
 
 
549 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  30.99 
 
 
547 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>