More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3385 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.38 
 
 
647 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  54.34 
 
 
647 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.89 
 
 
646 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
651 aa  1336    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.73 
 
 
647 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.59 
 
 
638 aa  595  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50 
 
 
644 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.1 
 
 
642 aa  571  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.9 
 
 
626 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.81 
 
 
614 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.17 
 
 
635 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  45.56 
 
 
635 aa  534  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.35 
 
 
629 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.71 
 
 
613 aa  508  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.79 
 
 
650 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.36 
 
 
607 aa  502  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  48.68 
 
 
614 aa  502  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.6 
 
 
610 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.72 
 
 
625 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.42 
 
 
613 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  43.33 
 
 
615 aa  485  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.93 
 
 
630 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.48 
 
 
620 aa  479  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  43.32 
 
 
649 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.25 
 
 
612 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3126  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.33 
 
 
633 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503601  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.16 
 
 
612 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.42 
 
 
617 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  44.85 
 
 
625 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.62 
 
 
628 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.61 
 
 
612 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44 
 
 
680 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  43.7 
 
 
621 aa  472  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.98 
 
 
627 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.62 
 
 
627 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.46 
 
 
627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.65 
 
 
643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.46 
 
 
627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.46 
 
 
627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.63 
 
 
648 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  44.01 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  43.37 
 
 
621 aa  469  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  44.01 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  44.01 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  44.01 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.98 
 
 
633 aa  467  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  44.09 
 
 
656 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.63 
 
 
652 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  44.01 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  44.01 
 
 
637 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.28 
 
 
627 aa  465  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  44.01 
 
 
637 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  44.35 
 
 
614 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.55 
 
 
630 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  46.46 
 
 
604 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  45.7 
 
 
603 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.89 
 
 
629 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.63 
 
 
670 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.09 
 
 
628 aa  455  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.13 
 
 
478 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.14 
 
 
609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0484  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.26 
 
 
648 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339951  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3816  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.47 
 
 
645 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.12 
 
 
619 aa  445  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3654  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.77 
 
 
656 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.772925  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0328  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.06 
 
 
613 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0440695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.14 
 
 
637 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1535  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.5 
 
 
635 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.6 
 
 
653 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1592  epimerase/dehydratase protein  40.33 
 
 
635 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1651  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.9 
 
 
637 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449332  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  38.24 
 
 
684 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.77 
 
 
656 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.52 
 
 
613 aa  424  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.97 
 
 
646 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.53 
 
 
605 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.53 
 
 
605 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.77 
 
 
616 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4766  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.3 
 
 
643 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0559289  normal  0.121979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.6 
 
 
669 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00896  epimerase  39.67 
 
 
635 aa  422  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.72 
 
 
647 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.49 
 
 
675 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  40.87 
 
 
670 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  40.38 
 
 
665 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.08 
 
 
682 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  41.05 
 
 
646 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0713  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.68 
 
 
641 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.13 
 
 
664 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.46 
 
 
647 aa  415  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.14 
 
 
655 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.58 
 
 
652 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.13 
 
 
653 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.44 
 
 
688 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0082  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.94 
 
 
660 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.44 
 
 
664 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0086  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.76 
 
 
645 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.96 
 
 
487 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.38 
 
 
623 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.6 
 
 
607 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>