More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3331 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 633 aa  1323    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.68 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.28 
 
 		 667 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.91 
 
 		 1106 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.14 
 
 		 589 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  39.56 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 		 1106 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 627 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 1714 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  37.81 
 
 		 717 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  37.81 
 
 		 717 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 708 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 789 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 968 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  42.75 
 
 		 937 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  32.74 
 
 		 780 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 780 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.77 
 
 		 529 aa  299  9e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 		 699 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 779 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.76 
 
 		 723 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  34.58 
 
 		 708 aa  293  8e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  34.23 
 
 		 1221 aa  293  9e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  34.7 
 
 		 797 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.4 
 
 		 790 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 776 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 790 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 776 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 776 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 776 aa  290  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 821 aa  290  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 821 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 776 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 828 aa  287  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 693 aa  279  9e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 754 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.81 
 
 		 781 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 822 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  33.26 
 
 		 1143 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  33.4 
 
 		 596 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 754 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 833 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 		 796 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 828 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 828 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 833 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 626 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 732 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 750 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 619 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 713 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 909 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 595 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 789 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 598 aa  257  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 734 aa  257  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  32.75 
 
 		 921 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 		 633 aa  253  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 647 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.25 
 
 		 715 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 824 aa  250  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  32 
 
 		 1415 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.22 
 
 		 1116 aa  247  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.02 
 
 		 739 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 727 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 718 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.89 
 
 		 739 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.55 
 
 		 816 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.11 
 
 		 739 aa  238  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  33.19 
 
 		 552 aa  237  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 1144 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.51 
 
 		 740 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 974 aa  230  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 667 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1085 aa  213  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 739 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  30.1 
 
 		 553 aa  213  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 3035 aa  212  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.23 
 
 		 742 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 700 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 3560 aa  206  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  33.58 
 
 		 492 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 733 aa  200  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  34.76 
 
 		 630 aa  200  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  30.57 
 
 		 568 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 616 aa  197  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 4489 aa  197  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1094 aa  195  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  29.06 
 
 		 680 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 740 aa  194  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 632 aa  194  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 654 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  34.68 
 
 		 657 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  33.69 
 
 		 657 aa  190  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  33.33 
 
 		 632 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.89 
 
 		 745 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  35.04 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 647 aa  187  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  34.23 
 
 		 566 aa  184  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 724 aa  181  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>