276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3251 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  45.06 
 
 
170 aa  124  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  38.13 
 
 
178 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
197 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  36.81 
 
 
459 aa  89.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
185 aa  87.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  41.18 
 
 
178 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  37.32 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  37.32 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 
203 aa  84  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
216 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  35.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  35.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  35.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  35.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  35.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  35.21 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  34.51 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  34.51 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  34.51 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  34.51 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  34.51 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.25 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3308  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.25 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  29.25 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.25 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.86 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.25 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.31 
 
 
213 aa  70.9  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  33.83 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.57 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.57 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.57 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3307  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.41 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.25 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.56 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.72 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.06 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  35.16 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1842  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.6 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743042  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.51 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.57 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.08 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.63 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  27.78 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.97 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11763  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.14 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.78 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.22 
 
 
227 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.33 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.22 
 
 
181 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.22 
 
 
181 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.22 
 
 
181 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  27.22 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.22 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4870  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.26 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0257995  normal  0.425035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.6 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.35 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.97 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.38 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.94 
 
 
198 aa  58.2  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.57 
 
 
181 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  40 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4731  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.83 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291133  decreased coverage  0.0000344266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21260  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.57 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.682268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.58 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  30.82 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2765  NUDIX hydrolase  31.22 
 
 
209 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  29.91 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.95 
 
 
216 aa  55.5  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
178 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>